Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrsam1Q80ZI6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrsam1Q80ZI6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrsam1Q80ZI6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrsam1Q80ZI6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrsam1Q80ZI6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrsam1Q80ZI6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrsam1Q80ZI6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrsam1Q80ZI6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrsam1Q80ZI6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrsam1Q80ZI6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrsam1Q80ZI6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrsam1Q80ZI6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrsam1Q80ZI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrsam1Q80ZI6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrsam1Q80ZI6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrsam1Q80ZI6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrsam1Q80ZI6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrsam1Q80ZI6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrsam1Q80ZI6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrsam1Q80ZI6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrsam1Q80ZI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrsam1Q80ZI6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrsam1Q80ZI6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrsam1Q80ZI6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrsam1Q80ZI6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrsam1Q80ZI6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrsam1Q80ZI6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrsam1Q80ZI6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrsam1Q80ZI6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrsam1Q80ZI6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrsam1Q80ZI6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrsam1Q80ZI6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrsam1Q80ZI6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrsam1Q80ZI6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrsam1Q80ZI6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrsam1Q80ZI6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrsam1Q80ZI6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrsam1Q80ZI6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrsam1Q80ZI6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrsam1Q80ZI6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrsam1Q80ZI6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrsam1Q80ZI6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrsam1Q80ZI6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrsam1Q80ZI6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrsam1Q80ZI6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrsam1Q80ZI6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrsam1Q80ZI6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrsam1Q80ZI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrsam1Q80ZI6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrsam1Q80ZI6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrsam1Q80ZI6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrsam1Q80ZI6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrsam1Q80ZI6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrsam1Q80ZI6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrsam1Q80ZI6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrsam1Q80ZI6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrsam1Q80ZI6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrsam1Q80ZI6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrsam1Q80ZI6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrsam1Q80ZI6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrsam1Q80ZI6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrsam1Q80ZI6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrsam1Q80ZI6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrsam1Q80ZI6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrsam1Q80ZI6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrsam1Q80ZI6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrsam1Q80ZI6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrsam1Q80ZI6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrsam1Q80ZI6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrsam1Q80ZI6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrsam1Q80ZI6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrsam1Q80ZI6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrsam1Q80ZI6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrsam1Q80ZI6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrsam1Q80ZI6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrsam1Q80ZI6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrsam1Q80ZI6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrsam1Q80ZI6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrsam1Q80ZI6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrsam1Q80ZI6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrsam1Q80ZI6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrsam1Q80ZI6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrsam1Q80ZI6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrsam1Q80ZI6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrsam1Q80ZI6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrsam1Q80ZI6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrsam1Q80ZI6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrsam1Q80ZI6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrsam1Q80ZI6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrsam1Q80ZI6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrsam1Q80ZI6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms