Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pja2Q80U04 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pja2Q80U04 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pja2Q80U04 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pja2Q80U04 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pja2Q80U04 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pja2Q80U04 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pja2Q80U04 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pja2Q80U04 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pja2Q80U04 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pja2Q80U04 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pja2Q80U04 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pja2Q80U04 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pja2Q80U04 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pja2Q80U04 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pja2Q80U04 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pja2Q80U04 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pja2Q80U04 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pja2Q80U04 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pja2Q80U04 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pja2Q80U04 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pja2Q80U04 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pja2Q80U04 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pja2Q80U04 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pja2Q80U04 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pja2Q80U04 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pja2Q80U04 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pja2Q80U04 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pja2Q80U04 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pja2Q80U04 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pja2Q80U04 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pja2Q80U04 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pja2Q80U04 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pja2Q80U04 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pja2Q80U04 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pja2Q80U04 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pja2Q80U04 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pja2Q80U04 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pja2Q80U04 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pja2Q80U04 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pja2Q80U04 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pja2Q80U04 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pja2Q80U04 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pja2Q80U04 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pja2Q80U04 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pja2Q80U04 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pja2Q80U04 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pja2Q80U04 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pja2Q80U04 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pja2Q80U04 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pja2Q80U04 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pja2Q80U04 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pja2Q80U04 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pja2Q80U04 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pja2Q80U04 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pja2Q80U04 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pja2Q80U04 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pja2Q80U04 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Pja2Q80U04 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pja2Q80U04 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pja2Q80U04 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pja2Q80U04 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pja2Q80U04 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pja2Q80U04 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pja2Q80U04 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pja2Q80U04 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pja2Q80U04 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pja2Q80U04 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pja2Q80U04 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pja2Q80U04 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pja2Q80U04 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pja2Q80U04 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pja2Q80U04 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pja2Q80U04 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pja2Q80U04 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pja2Q80U04 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pja2Q80U04 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Pja2Q80U04 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pja2Q80U04 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Pja2Q80U04 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pja2Q80U04 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pja2Q80U04 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pja2Q80U04 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pja2Q80U04 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pja2Q80U04 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pja2Q80U04 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pja2Q80U04 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pja2Q80U04 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pja2Q80U04 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pja2Q80U04 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pja2Q80U04 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pja2Q80U04 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms