Protein–RNA interactions for Protein: Q80TB8

Vat1l, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1lQ80TB8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Vat1lQ80TB8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vat1lQ80TB8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vat1lQ80TB8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vat1lQ80TB8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vat1lQ80TB8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vat1lQ80TB8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Vat1lQ80TB8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vat1lQ80TB8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vat1lQ80TB8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Vat1lQ80TB8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vat1lQ80TB8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vat1lQ80TB8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vat1lQ80TB8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vat1lQ80TB8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vat1lQ80TB8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vat1lQ80TB8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vat1lQ80TB8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Vat1lQ80TB8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vat1lQ80TB8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vat1lQ80TB8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vat1lQ80TB8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vat1lQ80TB8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vat1lQ80TB8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vat1lQ80TB8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vat1lQ80TB8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vat1lQ80TB8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vat1lQ80TB8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vat1lQ80TB8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Vat1lQ80TB8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vat1lQ80TB8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vat1lQ80TB8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Vat1lQ80TB8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vat1lQ80TB8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vat1lQ80TB8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vat1lQ80TB8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vat1lQ80TB8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vat1lQ80TB8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vat1lQ80TB8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vat1lQ80TB8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vat1lQ80TB8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Vat1lQ80TB8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vat1lQ80TB8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vat1lQ80TB8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Vat1lQ80TB8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vat1lQ80TB8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vat1lQ80TB8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vat1lQ80TB8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vat1lQ80TB8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vat1lQ80TB8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Vat1lQ80TB8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vat1lQ80TB8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vat1lQ80TB8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Vat1lQ80TB8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Vat1lQ80TB8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Vat1lQ80TB8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vat1lQ80TB8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vat1lQ80TB8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vat1lQ80TB8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vat1lQ80TB8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vat1lQ80TB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vat1lQ80TB8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vat1lQ80TB8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vat1lQ80TB8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vat1lQ80TB8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vat1lQ80TB8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Vat1lQ80TB8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vat1lQ80TB8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vat1lQ80TB8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vat1lQ80TB8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vat1lQ80TB8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vat1lQ80TB8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vat1lQ80TB8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vat1lQ80TB8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vat1lQ80TB8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vat1lQ80TB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vat1lQ80TB8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vat1lQ80TB8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vat1lQ80TB8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vat1lQ80TB8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vat1lQ80TB8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Vat1lQ80TB8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vat1lQ80TB8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vat1lQ80TB8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vat1lQ80TB8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vat1lQ80TB8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vat1lQ80TB8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vat1lQ80TB8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vat1lQ80TB8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vat1lQ80TB8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vat1lQ80TB8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vat1lQ80TB8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Vat1lQ80TB8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vat1lQ80TB8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vat1lQ80TB8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vat1lQ80TB8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vat1lQ80TB8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vat1lQ80TB8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vat1lQ80TB8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vat1lQ80TB8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms