Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN73

Casd1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casd1Q7TN73 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Casd1Q7TN73 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Casd1Q7TN73 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Casd1Q7TN73 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Casd1Q7TN73 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casd1Q7TN73 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Casd1Q7TN73 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Casd1Q7TN73 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Casd1Q7TN73 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Casd1Q7TN73 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Casd1Q7TN73 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Casd1Q7TN73 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Casd1Q7TN73 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Casd1Q7TN73 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casd1Q7TN73 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casd1Q7TN73 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Casd1Q7TN73 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Casd1Q7TN73 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Casd1Q7TN73 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Casd1Q7TN73 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Casd1Q7TN73 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Casd1Q7TN73 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Casd1Q7TN73 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Casd1Q7TN73 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Casd1Q7TN73 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Casd1Q7TN73 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Casd1Q7TN73 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Casd1Q7TN73 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Casd1Q7TN73 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Casd1Q7TN73 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Casd1Q7TN73 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Casd1Q7TN73 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Casd1Q7TN73 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Casd1Q7TN73 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casd1Q7TN73 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Casd1Q7TN73 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casd1Q7TN73 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Casd1Q7TN73 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casd1Q7TN73 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casd1Q7TN73 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Casd1Q7TN73 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Casd1Q7TN73 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Casd1Q7TN73 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Casd1Q7TN73 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Casd1Q7TN73 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Casd1Q7TN73 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casd1Q7TN73 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casd1Q7TN73 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Casd1Q7TN73 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casd1Q7TN73 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casd1Q7TN73 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Casd1Q7TN73 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casd1Q7TN73 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Casd1Q7TN73 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Casd1Q7TN73 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Casd1Q7TN73 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Casd1Q7TN73 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Casd1Q7TN73 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Casd1Q7TN73 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casd1Q7TN73 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casd1Q7TN73 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casd1Q7TN73 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Casd1Q7TN73 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Casd1Q7TN73 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Casd1Q7TN73 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Casd1Q7TN73 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Casd1Q7TN73 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casd1Q7TN73 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Casd1Q7TN73 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Casd1Q7TN73 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Casd1Q7TN73 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casd1Q7TN73 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Casd1Q7TN73 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Casd1Q7TN73 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casd1Q7TN73 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casd1Q7TN73 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casd1Q7TN73 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casd1Q7TN73 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casd1Q7TN73 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Casd1Q7TN73 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casd1Q7TN73 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casd1Q7TN73 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casd1Q7TN73 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Casd1Q7TN73 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casd1Q7TN73 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casd1Q7TN73 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casd1Q7TN73 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casd1Q7TN73 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casd1Q7TN73 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casd1Q7TN73 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms