Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap1s3Q7TN05 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap1s3Q7TN05 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap1s3Q7TN05 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap1s3Q7TN05 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap1s3Q7TN05 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap1s3Q7TN05 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap1s3Q7TN05 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s3Q7TN05 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s3Q7TN05 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap1s3Q7TN05 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap1s3Q7TN05 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1s3Q7TN05 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1s3Q7TN05 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1s3Q7TN05 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1s3Q7TN05 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1s3Q7TN05 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1s3Q7TN05 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1s3Q7TN05 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap1s3Q7TN05 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap1s3Q7TN05 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap1s3Q7TN05 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap1s3Q7TN05 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap1s3Q7TN05 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap1s3Q7TN05 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap1s3Q7TN05 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap1s3Q7TN05 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap1s3Q7TN05 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap1s3Q7TN05 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap1s3Q7TN05 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap1s3Q7TN05 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap1s3Q7TN05 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap1s3Q7TN05 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap1s3Q7TN05 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap1s3Q7TN05 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap1s3Q7TN05 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap1s3Q7TN05 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap1s3Q7TN05 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap1s3Q7TN05 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap1s3Q7TN05 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap1s3Q7TN05 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap1s3Q7TN05 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap1s3Q7TN05 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap1s3Q7TN05 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap1s3Q7TN05 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap1s3Q7TN05 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap1s3Q7TN05 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap1s3Q7TN05 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ap1s3Q7TN05 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap1s3Q7TN05 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap1s3Q7TN05 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap1s3Q7TN05 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap1s3Q7TN05 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap1s3Q7TN05 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap1s3Q7TN05 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap1s3Q7TN05 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap1s3Q7TN05 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap1s3Q7TN05 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap1s3Q7TN05 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap1s3Q7TN05 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s3Q7TN05 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s3Q7TN05 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s3Q7TN05 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1s3Q7TN05 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s3Q7TN05 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s3Q7TN05 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s3Q7TN05 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s3Q7TN05 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s3Q7TN05 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1s3Q7TN05 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s3Q7TN05 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1s3Q7TN05 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1s3Q7TN05 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap1s3Q7TN05 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap1s3Q7TN05 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s3Q7TN05 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms