Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
Rtl1Q7M732 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC51■■■■■ 5.75
Rtl1Q7M732 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC50.98■■■■■ 5.75
Rtl1Q7M732 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
Rtl1Q7M732 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC50.92■■■■■ 5.74
Rtl1Q7M732 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
Rtl1Q7M732 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
Rtl1Q7M732 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
Rtl1Q7M732 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
Rtl1Q7M732 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
Rtl1Q7M732 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC50.66■■■■■ 5.7
Rtl1Q7M732 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.65■■■■■ 5.7
Rtl1Q7M732 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
Rtl1Q7M732 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
Rtl1Q7M732 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
Rtl1Q7M732 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
Rtl1Q7M732 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
Rtl1Q7M732 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
Rtl1Q7M732 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
Rtl1Q7M732 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
Rtl1Q7M732 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.35■■■■■ 5.65
Rtl1Q7M732 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.32■■■■■ 5.65
Rtl1Q7M732 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
Rtl1Q7M732 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.26■■■■■ 5.64
Rtl1Q7M732 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
Rtl1Q7M732 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
Rtl1Q7M732 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
Rtl1Q7M732 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC50.18■■■■■ 5.62
Rtl1Q7M732 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
Rtl1Q7M732 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.09■■■■■ 5.61
Rtl1Q7M732 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Rtl1Q7M732 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.04■■■■■ 5.6
Rtl1Q7M732 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
Rtl1Q7M732 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
Rtl1Q7M732 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
Rtl1Q7M732 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
Rtl1Q7M732 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
Rtl1Q7M732 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC49.63■■■■■ 5.54
Rtl1Q7M732 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC49.63■■■■■ 5.53
Rtl1Q7M732 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
Rtl1Q7M732 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC49.57■■■■■ 5.53
Rtl1Q7M732 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC49.55■■■■■ 5.52
Rtl1Q7M732 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
Rtl1Q7M732 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
Rtl1Q7M732 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
Rtl1Q7M732 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC49.51■■■■■ 5.52
Rtl1Q7M732 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC49.48■■■■■ 5.51
Rtl1Q7M732 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
Rtl1Q7M732 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Rtl1Q7M732 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
Rtl1Q7M732 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Rtl1Q7M732 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC49.41■■■■■ 5.5
Rtl1Q7M732 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
Rtl1Q7M732 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
Rtl1Q7M732 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
Rtl1Q7M732 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
Rtl1Q7M732 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
Rtl1Q7M732 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC49.29■■■■■ 5.48
Rtl1Q7M732 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC49.25■■■■■ 5.47
Rtl1Q7M732 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
Rtl1Q7M732 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC49.15■■■■■ 5.46
Rtl1Q7M732 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
Rtl1Q7M732 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
Rtl1Q7M732 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
Rtl1Q7M732 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC49.09■■■■■ 5.45
Rtl1Q7M732 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
Rtl1Q7M732 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
Rtl1Q7M732 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
Rtl1Q7M732 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.44
Rtl1Q7M732 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
Rtl1Q7M732 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
Rtl1Q7M732 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
Rtl1Q7M732 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
Rtl1Q7M732 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
Rtl1Q7M732 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
Rtl1Q7M732 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
Rtl1Q7M732 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
Rtl1Q7M732 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
Rtl1Q7M732 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.66■■■■■ 5.38
Rtl1Q7M732 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
Rtl1Q7M732 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Rtl1Q7M732 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
Rtl1Q7M732 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
Rtl1Q7M732 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
Rtl1Q7M732 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
Rtl1Q7M732 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
Rtl1Q7M732 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
Rtl1Q7M732 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
Rtl1Q7M732 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
Rtl1Q7M732 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.38■■■■■ 5.34
Rtl1Q7M732 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC48.34■■■■■ 5.33
Rtl1Q7M732 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
Rtl1Q7M732 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Rtl1Q7M732 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Rtl1Q7M732 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Rtl1Q7M732 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.3■■■■■ 5.32
Rtl1Q7M732 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
Rtl1Q7M732 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
Rtl1Q7M732 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Rtl1Q7M732 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms