Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Efr3bQ6ZQ18 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Efr3bQ6ZQ18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Efr3bQ6ZQ18 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Efr3bQ6ZQ18 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Efr3bQ6ZQ18 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Efr3bQ6ZQ18 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Efr3bQ6ZQ18 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Efr3bQ6ZQ18 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Efr3bQ6ZQ18 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Efr3bQ6ZQ18 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Efr3bQ6ZQ18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Efr3bQ6ZQ18 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Efr3bQ6ZQ18 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Efr3bQ6ZQ18 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Efr3bQ6ZQ18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Efr3bQ6ZQ18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efr3bQ6ZQ18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Efr3bQ6ZQ18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Efr3bQ6ZQ18 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Efr3bQ6ZQ18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efr3bQ6ZQ18 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Efr3bQ6ZQ18 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efr3bQ6ZQ18 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efr3bQ6ZQ18 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efr3bQ6ZQ18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efr3bQ6ZQ18 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Efr3bQ6ZQ18 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Efr3bQ6ZQ18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Efr3bQ6ZQ18 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Efr3bQ6ZQ18 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Efr3bQ6ZQ18 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Efr3bQ6ZQ18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efr3bQ6ZQ18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efr3bQ6ZQ18 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Efr3bQ6ZQ18 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efr3bQ6ZQ18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efr3bQ6ZQ18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efr3bQ6ZQ18 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efr3bQ6ZQ18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efr3bQ6ZQ18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Efr3bQ6ZQ18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Efr3bQ6ZQ18 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Efr3bQ6ZQ18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Efr3bQ6ZQ18 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Efr3bQ6ZQ18 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Efr3bQ6ZQ18 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efr3bQ6ZQ18 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Efr3bQ6ZQ18 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efr3bQ6ZQ18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efr3bQ6ZQ18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efr3bQ6ZQ18 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efr3bQ6ZQ18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms