Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chsy1Q6ZQ11 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chsy1Q6ZQ11 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chsy1Q6ZQ11 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chsy1Q6ZQ11 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chsy1Q6ZQ11 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chsy1Q6ZQ11 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chsy1Q6ZQ11 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chsy1Q6ZQ11 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chsy1Q6ZQ11 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chsy1Q6ZQ11 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Chsy1Q6ZQ11 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chsy1Q6ZQ11 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chsy1Q6ZQ11 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chsy1Q6ZQ11 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chsy1Q6ZQ11 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chsy1Q6ZQ11 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chsy1Q6ZQ11 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chsy1Q6ZQ11 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chsy1Q6ZQ11 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chsy1Q6ZQ11 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chsy1Q6ZQ11 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chsy1Q6ZQ11 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chsy1Q6ZQ11 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chsy1Q6ZQ11 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chsy1Q6ZQ11 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chsy1Q6ZQ11 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chsy1Q6ZQ11 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chsy1Q6ZQ11 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chsy1Q6ZQ11 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chsy1Q6ZQ11 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Chsy1Q6ZQ11 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chsy1Q6ZQ11 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chsy1Q6ZQ11 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chsy1Q6ZQ11 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chsy1Q6ZQ11 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chsy1Q6ZQ11 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chsy1Q6ZQ11 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chsy1Q6ZQ11 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chsy1Q6ZQ11 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chsy1Q6ZQ11 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Chsy1Q6ZQ11 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chsy1Q6ZQ11 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Chsy1Q6ZQ11 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chsy1Q6ZQ11 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chsy1Q6ZQ11 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chsy1Q6ZQ11 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chsy1Q6ZQ11 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Chsy1Q6ZQ11 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chsy1Q6ZQ11 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chsy1Q6ZQ11 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chsy1Q6ZQ11 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Chsy1Q6ZQ11 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chsy1Q6ZQ11 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Chsy1Q6ZQ11 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chsy1Q6ZQ11 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chsy1Q6ZQ11 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chsy1Q6ZQ11 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chsy1Q6ZQ11 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chsy1Q6ZQ11 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chsy1Q6ZQ11 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chsy1Q6ZQ11 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chsy1Q6ZQ11 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Chsy1Q6ZQ11 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chsy1Q6ZQ11 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chsy1Q6ZQ11 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Chsy1Q6ZQ11 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chsy1Q6ZQ11 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chsy1Q6ZQ11 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chsy1Q6ZQ11 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chsy1Q6ZQ11 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chsy1Q6ZQ11 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chsy1Q6ZQ11 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chsy1Q6ZQ11 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chsy1Q6ZQ11 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chsy1Q6ZQ11 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chsy1Q6ZQ11 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chsy1Q6ZQ11 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chsy1Q6ZQ11 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chsy1Q6ZQ11 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chsy1Q6ZQ11 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chsy1Q6ZQ11 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chsy1Q6ZQ11 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chsy1Q6ZQ11 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chsy1Q6ZQ11 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chsy1Q6ZQ11 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chsy1Q6ZQ11 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Chsy1Q6ZQ11 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chsy1Q6ZQ11 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chsy1Q6ZQ11 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chsy1Q6ZQ11 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Chsy1Q6ZQ11 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chsy1Q6ZQ11 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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