Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smg5Q6ZPY2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smg5Q6ZPY2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smg5Q6ZPY2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smg5Q6ZPY2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smg5Q6ZPY2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smg5Q6ZPY2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smg5Q6ZPY2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smg5Q6ZPY2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smg5Q6ZPY2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smg5Q6ZPY2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smg5Q6ZPY2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smg5Q6ZPY2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg5Q6ZPY2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg5Q6ZPY2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg5Q6ZPY2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smg5Q6ZPY2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smg5Q6ZPY2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg5Q6ZPY2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smg5Q6ZPY2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smg5Q6ZPY2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg5Q6ZPY2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smg5Q6ZPY2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg5Q6ZPY2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg5Q6ZPY2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Smg5Q6ZPY2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smg5Q6ZPY2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg5Q6ZPY2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg5Q6ZPY2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smg5Q6ZPY2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smg5Q6ZPY2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smg5Q6ZPY2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg5Q6ZPY2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smg5Q6ZPY2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smg5Q6ZPY2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smg5Q6ZPY2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Smg5Q6ZPY2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Smg5Q6ZPY2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg5Q6ZPY2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg5Q6ZPY2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg5Q6ZPY2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smg5Q6ZPY2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg5Q6ZPY2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smg5Q6ZPY2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smg5Q6ZPY2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smg5Q6ZPY2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg5Q6ZPY2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg5Q6ZPY2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smg5Q6ZPY2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smg5Q6ZPY2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg5Q6ZPY2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg5Q6ZPY2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg5Q6ZPY2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smg5Q6ZPY2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smg5Q6ZPY2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg5Q6ZPY2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg5Q6ZPY2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg5Q6ZPY2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg5Q6ZPY2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smg5Q6ZPY2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smg5Q6ZPY2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smg5Q6ZPY2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg5Q6ZPY2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smg5Q6ZPY2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smg5Q6ZPY2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg5Q6ZPY2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg5Q6ZPY2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Smg5Q6ZPY2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg5Q6ZPY2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg5Q6ZPY2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg5Q6ZPY2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg5Q6ZPY2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg5Q6ZPY2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg5Q6ZPY2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg5Q6ZPY2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg5Q6ZPY2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smg5Q6ZPY2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smg5Q6ZPY2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smg5Q6ZPY2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms