Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neil2Q6R2P8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Neil2Q6R2P8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neil2Q6R2P8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neil2Q6R2P8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neil2Q6R2P8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neil2Q6R2P8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neil2Q6R2P8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neil2Q6R2P8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neil2Q6R2P8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neil2Q6R2P8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neil2Q6R2P8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Neil2Q6R2P8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neil2Q6R2P8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neil2Q6R2P8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neil2Q6R2P8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neil2Q6R2P8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neil2Q6R2P8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neil2Q6R2P8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Neil2Q6R2P8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neil2Q6R2P8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neil2Q6R2P8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neil2Q6R2P8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neil2Q6R2P8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neil2Q6R2P8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neil2Q6R2P8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neil2Q6R2P8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neil2Q6R2P8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Neil2Q6R2P8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neil2Q6R2P8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neil2Q6R2P8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neil2Q6R2P8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neil2Q6R2P8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neil2Q6R2P8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neil2Q6R2P8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neil2Q6R2P8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neil2Q6R2P8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neil2Q6R2P8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neil2Q6R2P8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neil2Q6R2P8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neil2Q6R2P8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neil2Q6R2P8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neil2Q6R2P8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neil2Q6R2P8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neil2Q6R2P8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neil2Q6R2P8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Neil2Q6R2P8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Neil2Q6R2P8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neil2Q6R2P8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neil2Q6R2P8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neil2Q6R2P8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neil2Q6R2P8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neil2Q6R2P8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neil2Q6R2P8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neil2Q6R2P8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neil2Q6R2P8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neil2Q6R2P8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neil2Q6R2P8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neil2Q6R2P8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neil2Q6R2P8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Neil2Q6R2P8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neil2Q6R2P8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neil2Q6R2P8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neil2Q6R2P8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neil2Q6R2P8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neil2Q6R2P8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neil2Q6R2P8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neil2Q6R2P8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neil2Q6R2P8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Neil2Q6R2P8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Neil2Q6R2P8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neil2Q6R2P8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neil2Q6R2P8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neil2Q6R2P8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neil2Q6R2P8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neil2Q6R2P8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neil2Q6R2P8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neil2Q6R2P8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neil2Q6R2P8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Neil2Q6R2P8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Neil2Q6R2P8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neil2Q6R2P8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neil2Q6R2P8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Neil2Q6R2P8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neil2Q6R2P8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neil2Q6R2P8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neil2Q6R2P8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neil2Q6R2P8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Neil2Q6R2P8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neil2Q6R2P8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neil2Q6R2P8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms