Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dclk2Q6PGN3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Dclk2Q6PGN3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dclk2Q6PGN3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dclk2Q6PGN3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dclk2Q6PGN3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dclk2Q6PGN3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dclk2Q6PGN3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Dclk2Q6PGN3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dclk2Q6PGN3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dclk2Q6PGN3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dclk2Q6PGN3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dclk2Q6PGN3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Dclk2Q6PGN3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dclk2Q6PGN3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Dclk2Q6PGN3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dclk2Q6PGN3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dclk2Q6PGN3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dclk2Q6PGN3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dclk2Q6PGN3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dclk2Q6PGN3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk2Q6PGN3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk2Q6PGN3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dclk2Q6PGN3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dclk2Q6PGN3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dclk2Q6PGN3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dclk2Q6PGN3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dclk2Q6PGN3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dclk2Q6PGN3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dclk2Q6PGN3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dclk2Q6PGN3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dclk2Q6PGN3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dclk2Q6PGN3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dclk2Q6PGN3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dclk2Q6PGN3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dclk2Q6PGN3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Dclk2Q6PGN3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Dclk2Q6PGN3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dclk2Q6PGN3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dclk2Q6PGN3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dclk2Q6PGN3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dclk2Q6PGN3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dclk2Q6PGN3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dclk2Q6PGN3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dclk2Q6PGN3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dclk2Q6PGN3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Dclk2Q6PGN3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dclk2Q6PGN3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dclk2Q6PGN3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Dclk2Q6PGN3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dclk2Q6PGN3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dclk2Q6PGN3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dclk2Q6PGN3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dclk2Q6PGN3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Dclk2Q6PGN3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dclk2Q6PGN3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Dclk2Q6PGN3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dclk2Q6PGN3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Dclk2Q6PGN3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dclk2Q6PGN3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dclk2Q6PGN3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dclk2Q6PGN3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dclk2Q6PGN3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dclk2Q6PGN3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dclk2Q6PGN3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dclk2Q6PGN3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dclk2Q6PGN3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dclk2Q6PGN3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dclk2Q6PGN3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dclk2Q6PGN3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Dclk2Q6PGN3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dclk2Q6PGN3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dclk2Q6PGN3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dclk2Q6PGN3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dclk2Q6PGN3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dclk2Q6PGN3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dclk2Q6PGN3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Dclk2Q6PGN3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dclk2Q6PGN3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dclk2Q6PGN3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dclk2Q6PGN3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dclk2Q6PGN3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dclk2Q6PGN3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dclk2Q6PGN3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dclk2Q6PGN3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dclk2Q6PGN3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dclk2Q6PGN3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dclk2Q6PGN3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dclk2Q6PGN3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Dclk2Q6PGN3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dclk2Q6PGN3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dclk2Q6PGN3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dclk2Q6PGN3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dclk2Q6PGN3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dclk2Q6PGN3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dclk2Q6PGN3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dclk2Q6PGN3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dclk2Q6PGN3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dclk2Q6PGN3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dclk2Q6PGN3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms