Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Y1

Capsl, Calcyphosin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CapslQ6P8Y1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CapslQ6P8Y1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CapslQ6P8Y1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CapslQ6P8Y1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CapslQ6P8Y1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CapslQ6P8Y1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CapslQ6P8Y1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CapslQ6P8Y1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CapslQ6P8Y1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CapslQ6P8Y1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CapslQ6P8Y1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CapslQ6P8Y1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CapslQ6P8Y1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CapslQ6P8Y1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CapslQ6P8Y1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CapslQ6P8Y1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CapslQ6P8Y1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CapslQ6P8Y1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CapslQ6P8Y1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CapslQ6P8Y1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CapslQ6P8Y1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CapslQ6P8Y1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CapslQ6P8Y1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CapslQ6P8Y1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CapslQ6P8Y1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CapslQ6P8Y1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CapslQ6P8Y1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CapslQ6P8Y1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CapslQ6P8Y1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CapslQ6P8Y1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CapslQ6P8Y1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CapslQ6P8Y1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CapslQ6P8Y1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CapslQ6P8Y1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CapslQ6P8Y1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CapslQ6P8Y1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CapslQ6P8Y1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CapslQ6P8Y1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CapslQ6P8Y1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CapslQ6P8Y1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CapslQ6P8Y1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CapslQ6P8Y1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CapslQ6P8Y1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CapslQ6P8Y1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CapslQ6P8Y1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CapslQ6P8Y1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CapslQ6P8Y1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CapslQ6P8Y1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CapslQ6P8Y1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CapslQ6P8Y1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CapslQ6P8Y1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CapslQ6P8Y1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CapslQ6P8Y1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CapslQ6P8Y1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CapslQ6P8Y1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CapslQ6P8Y1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CapslQ6P8Y1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CapslQ6P8Y1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CapslQ6P8Y1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CapslQ6P8Y1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CapslQ6P8Y1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CapslQ6P8Y1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CapslQ6P8Y1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CapslQ6P8Y1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CapslQ6P8Y1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CapslQ6P8Y1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CapslQ6P8Y1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CapslQ6P8Y1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CapslQ6P8Y1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CapslQ6P8Y1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CapslQ6P8Y1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CapslQ6P8Y1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CapslQ6P8Y1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CapslQ6P8Y1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CapslQ6P8Y1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CapslQ6P8Y1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms