Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcnpQ6P8I4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PcnpQ6P8I4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcnpQ6P8I4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PcnpQ6P8I4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PcnpQ6P8I4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PcnpQ6P8I4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PcnpQ6P8I4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PcnpQ6P8I4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PcnpQ6P8I4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcnpQ6P8I4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcnpQ6P8I4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PcnpQ6P8I4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PcnpQ6P8I4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcnpQ6P8I4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PcnpQ6P8I4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcnpQ6P8I4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PcnpQ6P8I4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PcnpQ6P8I4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PcnpQ6P8I4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PcnpQ6P8I4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PcnpQ6P8I4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcnpQ6P8I4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PcnpQ6P8I4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcnpQ6P8I4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PcnpQ6P8I4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PcnpQ6P8I4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcnpQ6P8I4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcnpQ6P8I4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcnpQ6P8I4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PcnpQ6P8I4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnpQ6P8I4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnpQ6P8I4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcnpQ6P8I4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcnpQ6P8I4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PcnpQ6P8I4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcnpQ6P8I4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcnpQ6P8I4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcnpQ6P8I4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcnpQ6P8I4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnpQ6P8I4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcnpQ6P8I4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcnpQ6P8I4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcnpQ6P8I4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcnpQ6P8I4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PcnpQ6P8I4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PcnpQ6P8I4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcnpQ6P8I4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcnpQ6P8I4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcnpQ6P8I4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcnpQ6P8I4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PcnpQ6P8I4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PcnpQ6P8I4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcnpQ6P8I4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcnpQ6P8I4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcnpQ6P8I4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PcnpQ6P8I4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PcnpQ6P8I4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcnpQ6P8I4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcnpQ6P8I4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcnpQ6P8I4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PcnpQ6P8I4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PcnpQ6P8I4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PcnpQ6P8I4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms