Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI8

Cxxc4, CXXC-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc4Q6NXI8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxxc4Q6NXI8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxxc4Q6NXI8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxxc4Q6NXI8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxxc4Q6NXI8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxxc4Q6NXI8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxxc4Q6NXI8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxxc4Q6NXI8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxxc4Q6NXI8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxxc4Q6NXI8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxxc4Q6NXI8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cxxc4Q6NXI8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxxc4Q6NXI8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxxc4Q6NXI8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxxc4Q6NXI8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxxc4Q6NXI8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxxc4Q6NXI8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxxc4Q6NXI8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxxc4Q6NXI8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxxc4Q6NXI8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxxc4Q6NXI8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxxc4Q6NXI8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxxc4Q6NXI8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxxc4Q6NXI8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxxc4Q6NXI8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxxc4Q6NXI8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxxc4Q6NXI8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxxc4Q6NXI8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxxc4Q6NXI8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxxc4Q6NXI8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxxc4Q6NXI8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxxc4Q6NXI8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxxc4Q6NXI8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxxc4Q6NXI8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxxc4Q6NXI8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxxc4Q6NXI8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxxc4Q6NXI8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxxc4Q6NXI8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxxc4Q6NXI8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxxc4Q6NXI8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxxc4Q6NXI8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxxc4Q6NXI8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxxc4Q6NXI8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxxc4Q6NXI8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxxc4Q6NXI8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxxc4Q6NXI8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxxc4Q6NXI8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxxc4Q6NXI8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxxc4Q6NXI8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxxc4Q6NXI8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxxc4Q6NXI8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxxc4Q6NXI8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxxc4Q6NXI8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxxc4Q6NXI8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxxc4Q6NXI8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxxc4Q6NXI8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxxc4Q6NXI8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxxc4Q6NXI8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxxc4Q6NXI8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxxc4Q6NXI8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxxc4Q6NXI8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxxc4Q6NXI8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxxc4Q6NXI8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxxc4Q6NXI8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxxc4Q6NXI8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc4Q6NXI8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc4Q6NXI8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxxc4Q6NXI8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxxc4Q6NXI8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxxc4Q6NXI8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxxc4Q6NXI8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxxc4Q6NXI8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxxc4Q6NXI8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxxc4Q6NXI8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxxc4Q6NXI8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxxc4Q6NXI8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxxc4Q6NXI8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc4Q6NXI8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc4Q6NXI8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxxc4Q6NXI8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxxc4Q6NXI8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxxc4Q6NXI8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxxc4Q6NXI8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxxc4Q6NXI8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxxc4Q6NXI8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxxc4Q6NXI8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxxc4Q6NXI8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxxc4Q6NXI8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cxxc4Q6NXI8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxxc4Q6NXI8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxxc4Q6NXI8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxxc4Q6NXI8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms