Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE9

Tshz2, Teashirt homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz2Q68FE9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tshz2Q68FE9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tshz2Q68FE9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tshz2Q68FE9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tshz2Q68FE9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tshz2Q68FE9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tshz2Q68FE9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Tshz2Q68FE9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tshz2Q68FE9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tshz2Q68FE9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tshz2Q68FE9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tshz2Q68FE9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tshz2Q68FE9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tshz2Q68FE9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tshz2Q68FE9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tshz2Q68FE9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tshz2Q68FE9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tshz2Q68FE9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tshz2Q68FE9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tshz2Q68FE9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tshz2Q68FE9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tshz2Q68FE9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tshz2Q68FE9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tshz2Q68FE9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tshz2Q68FE9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tshz2Q68FE9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tshz2Q68FE9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tshz2Q68FE9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tshz2Q68FE9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tshz2Q68FE9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tshz2Q68FE9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tshz2Q68FE9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tshz2Q68FE9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tshz2Q68FE9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tshz2Q68FE9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tshz2Q68FE9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tshz2Q68FE9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tshz2Q68FE9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tshz2Q68FE9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tshz2Q68FE9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tshz2Q68FE9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tshz2Q68FE9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Tshz2Q68FE9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tshz2Q68FE9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tshz2Q68FE9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tshz2Q68FE9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tshz2Q68FE9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tshz2Q68FE9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tshz2Q68FE9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tshz2Q68FE9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tshz2Q68FE9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tshz2Q68FE9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tshz2Q68FE9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tshz2Q68FE9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tshz2Q68FE9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tshz2Q68FE9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tshz2Q68FE9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tshz2Q68FE9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tshz2Q68FE9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tshz2Q68FE9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tshz2Q68FE9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tshz2Q68FE9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tshz2Q68FE9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tshz2Q68FE9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tshz2Q68FE9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tshz2Q68FE9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tshz2Q68FE9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tshz2Q68FE9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tshz2Q68FE9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tshz2Q68FE9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tshz2Q68FE9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tshz2Q68FE9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tshz2Q68FE9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tshz2Q68FE9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tshz2Q68FE9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tshz2Q68FE9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tshz2Q68FE9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tshz2Q68FE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tshz2Q68FE9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tshz2Q68FE9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tshz2Q68FE9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tshz2Q68FE9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tshz2Q68FE9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tshz2Q68FE9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tshz2Q68FE9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tshz2Q68FE9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tshz2Q68FE9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tshz2Q68FE9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tshz2Q68FE9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tshz2Q68FE9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tshz2Q68FE9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms