Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Atp7bQ64446 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Atp7bQ64446 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Atp7bQ64446 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Atp7bQ64446 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Atp7bQ64446 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Atp7bQ64446 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Atp7bQ64446 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Atp7bQ64446 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Atp7bQ64446 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Atp7bQ64446 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Atp7bQ64446 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Atp7bQ64446 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Atp7bQ64446 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Atp7bQ64446 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Atp7bQ64446 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Atp7bQ64446 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Atp7bQ64446 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Atp7bQ64446 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Atp7bQ64446 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Atp7bQ64446 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Atp7bQ64446 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Atp7bQ64446 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Atp7bQ64446 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Atp7bQ64446 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Atp7bQ64446 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Atp7bQ64446 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Atp7bQ64446 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Atp7bQ64446 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Atp7bQ64446 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Atp7bQ64446 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Atp7bQ64446 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Atp7bQ64446 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Atp7bQ64446 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Atp7bQ64446 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Atp7bQ64446 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Atp7bQ64446 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Atp7bQ64446 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Atp7bQ64446 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Atp7bQ64446 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Atp7bQ64446 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Atp7bQ64446 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Atp7bQ64446 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Atp7bQ64446 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Atp7bQ64446 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Atp7bQ64446 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Atp7bQ64446 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Atp7bQ64446 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Atp7bQ64446 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Atp7bQ64446 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Atp7bQ64446 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Atp7bQ64446 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Atp7bQ64446 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Atp7bQ64446 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Atp7bQ64446 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atp7bQ64446 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atp7bQ64446 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atp7bQ64446 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atp7bQ64446 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atp7bQ64446 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atp7bQ64446 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Atp7bQ64446 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Atp7bQ64446 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Atp7bQ64446 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Atp7bQ64446 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Atp7bQ64446 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atp7bQ64446 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Atp7bQ64446 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Atp7bQ64446 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Atp7bQ64446 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Atp7bQ64446 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Atp7bQ64446 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Atp7bQ64446 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Atp7bQ64446 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Atp7bQ64446 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Atp7bQ64446 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Atp7bQ64446 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Atp7bQ64446 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Atp7bQ64446 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Atp7bQ64446 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Atp7bQ64446 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Atp7bQ64446 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Atp7bQ64446 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Atp7bQ64446 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Atp7bQ64446 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Atp7bQ64446 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Atp7bQ64446 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Atp7bQ64446 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Atp7bQ64446 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Atp7bQ64446 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atp7bQ64446 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Atp7bQ64446 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Atp7bQ64446 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Atp7bQ64446 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Atp7bQ64446 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Atp7bQ64446 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Atp7bQ64446 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Atp7bQ64446 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Atp7bQ64446 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Atp7bQ64446 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms