Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pou4f3Q63955 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pou4f3Q63955 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pou4f3Q63955 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pou4f3Q63955 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pou4f3Q63955 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pou4f3Q63955 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pou4f3Q63955 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pou4f3Q63955 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pou4f3Q63955 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pou4f3Q63955 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pou4f3Q63955 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pou4f3Q63955 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pou4f3Q63955 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou4f3Q63955 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pou4f3Q63955 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pou4f3Q63955 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pou4f3Q63955 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pou4f3Q63955 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pou4f3Q63955 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pou4f3Q63955 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pou4f3Q63955 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pou4f3Q63955 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pou4f3Q63955 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pou4f3Q63955 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pou4f3Q63955 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pou4f3Q63955 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pou4f3Q63955 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pou4f3Q63955 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pou4f3Q63955 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pou4f3Q63955 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pou4f3Q63955 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pou4f3Q63955 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pou4f3Q63955 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pou4f3Q63955 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pou4f3Q63955 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou4f3Q63955 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou4f3Q63955 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou4f3Q63955 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou4f3Q63955 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou4f3Q63955 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou4f3Q63955 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pou4f3Q63955 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou4f3Q63955 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou4f3Q63955 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou4f3Q63955 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou4f3Q63955 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pou4f3Q63955 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou4f3Q63955 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou4f3Q63955 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou4f3Q63955 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pou4f3Q63955 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pou4f3Q63955 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou4f3Q63955 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou4f3Q63955 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou4f3Q63955 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pou4f3Q63955 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pou4f3Q63955 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pou4f3Q63955 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou4f3Q63955 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou4f3Q63955 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou4f3Q63955 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pou4f3Q63955 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pou4f3Q63955 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pou4f3Q63955 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou4f3Q63955 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou4f3Q63955 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou4f3Q63955 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou4f3Q63955 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou4f3Q63955 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou4f3Q63955 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou4f3Q63955 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou4f3Q63955 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou4f3Q63955 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou4f3Q63955 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou4f3Q63955 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou4f3Q63955 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou4f3Q63955 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou4f3Q63955 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou4f3Q63955 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou4f3Q63955 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou4f3Q63955 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou4f3Q63955 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou4f3Q63955 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou4f3Q63955 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou4f3Q63955 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou4f3Q63955 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f3Q63955 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou4f3Q63955 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou4f3Q63955 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou4f3Q63955 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou4f3Q63955 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou4f3Q63955 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou4f3Q63955 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou4f3Q63955 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou4f3Q63955 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou4f3Q63955 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pou4f3Q63955 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou4f3Q63955 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou4f3Q63955 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms