Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf260Q62513 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf260Q62513 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf260Q62513 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf260Q62513 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Znf260Q62513 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf260Q62513 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf260Q62513 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf260Q62513 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf260Q62513 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf260Q62513 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf260Q62513 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf260Q62513 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf260Q62513 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf260Q62513 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf260Q62513 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf260Q62513 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf260Q62513 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf260Q62513 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf260Q62513 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf260Q62513 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf260Q62513 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf260Q62513 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf260Q62513 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf260Q62513 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf260Q62513 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf260Q62513 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf260Q62513 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf260Q62513 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf260Q62513 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf260Q62513 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf260Q62513 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf260Q62513 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf260Q62513 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf260Q62513 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf260Q62513 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf260Q62513 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf260Q62513 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf260Q62513 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf260Q62513 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf260Q62513 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf260Q62513 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf260Q62513 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf260Q62513 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf260Q62513 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf260Q62513 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf260Q62513 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf260Q62513 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf260Q62513 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf260Q62513 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf260Q62513 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf260Q62513 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf260Q62513 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf260Q62513 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf260Q62513 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf260Q62513 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf260Q62513 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf260Q62513 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf260Q62513 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf260Q62513 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf260Q62513 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf260Q62513 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf260Q62513 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf260Q62513 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf260Q62513 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf260Q62513 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf260Q62513 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf260Q62513 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf260Q62513 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf260Q62513 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf260Q62513 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf260Q62513 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf260Q62513 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf260Q62513 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf260Q62513 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf260Q62513 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf260Q62513 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf260Q62513 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf260Q62513 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf260Q62513 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf260Q62513 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf260Q62513 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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