Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phox2aQ62066 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2aQ62066 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2aQ62066 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2aQ62066 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phox2aQ62066 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phox2aQ62066 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phox2aQ62066 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phox2aQ62066 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phox2aQ62066 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phox2aQ62066 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phox2aQ62066 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2aQ62066 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phox2aQ62066 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phox2aQ62066 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phox2aQ62066 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phox2aQ62066 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phox2aQ62066 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phox2aQ62066 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phox2aQ62066 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phox2aQ62066 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Phox2aQ62066 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phox2aQ62066 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phox2aQ62066 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phox2aQ62066 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phox2aQ62066 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phox2aQ62066 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phox2aQ62066 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phox2aQ62066 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phox2aQ62066 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phox2aQ62066 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phox2aQ62066 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phox2aQ62066 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phox2aQ62066 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phox2aQ62066 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phox2aQ62066 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2aQ62066 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2aQ62066 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2aQ62066 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phox2aQ62066 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phox2aQ62066 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phox2aQ62066 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phox2aQ62066 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phox2aQ62066 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2aQ62066 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2aQ62066 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2aQ62066 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phox2aQ62066 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phox2aQ62066 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phox2aQ62066 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phox2aQ62066 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phox2aQ62066 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phox2aQ62066 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phox2aQ62066 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2aQ62066 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phox2aQ62066 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phox2aQ62066 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phox2aQ62066 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phox2aQ62066 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phox2aQ62066 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phox2aQ62066 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phox2aQ62066 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phox2aQ62066 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms