Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Itga6Q61739 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Itga6Q61739 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Itga6Q61739 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Itga6Q61739 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Itga6Q61739 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Itga6Q61739 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Itga6Q61739 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Itga6Q61739 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Itga6Q61739 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Itga6Q61739 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Itga6Q61739 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Itga6Q61739 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Itga6Q61739 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Itga6Q61739 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Itga6Q61739 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Itga6Q61739 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Itga6Q61739 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Itga6Q61739 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Itga6Q61739 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Itga6Q61739 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Itga6Q61739 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Itga6Q61739 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Itga6Q61739 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Itga6Q61739 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Itga6Q61739 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Itga6Q61739 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Itga6Q61739 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Itga6Q61739 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Itga6Q61739 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Itga6Q61739 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Itga6Q61739 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Itga6Q61739 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Itga6Q61739 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Itga6Q61739 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Itga6Q61739 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Itga6Q61739 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Itga6Q61739 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Itga6Q61739 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Itga6Q61739 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Itga6Q61739 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Itga6Q61739 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Itga6Q61739 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Itga6Q61739 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Itga6Q61739 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Itga6Q61739 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Itga6Q61739 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Itga6Q61739 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Itga6Q61739 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Itga6Q61739 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Itga6Q61739 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Itga6Q61739 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Itga6Q61739 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Itga6Q61739 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Itga6Q61739 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Itga6Q61739 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Itga6Q61739 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Itga6Q61739 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Itga6Q61739 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Itga6Q61739 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Itga6Q61739 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Itga6Q61739 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Itga6Q61739 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Itga6Q61739 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Itga6Q61739 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Itga6Q61739 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Itga6Q61739 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Itga6Q61739 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Itga6Q61739 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Itga6Q61739 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Itga6Q61739 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Itga6Q61739 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Itga6Q61739 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Itga6Q61739 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Itga6Q61739 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Itga6Q61739 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Itga6Q61739 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Itga6Q61739 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Itga6Q61739 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Itga6Q61739 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Itga6Q61739 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Itga6Q61739 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Itga6Q61739 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Itga6Q61739 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Itga6Q61739 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Itga6Q61739 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Itga6Q61739 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Itga6Q61739 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Itga6Q61739 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Itga6Q61739 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Itga6Q61739 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Itga6Q61739 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Itga6Q61739 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Itga6Q61739 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Itga6Q61739 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Itga6Q61739 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Itga6Q61739 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Itga6Q61739 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Itga6Q61739 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Itga6Q61739 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms