Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hes3Q61657 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hes3Q61657 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hes3Q61657 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hes3Q61657 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hes3Q61657 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes3Q61657 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hes3Q61657 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hes3Q61657 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes3Q61657 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hes3Q61657 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hes3Q61657 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hes3Q61657 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hes3Q61657 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hes3Q61657 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hes3Q61657 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hes3Q61657 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hes3Q61657 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hes3Q61657 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hes3Q61657 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes3Q61657 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hes3Q61657 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes3Q61657 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hes3Q61657 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hes3Q61657 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hes3Q61657 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hes3Q61657 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hes3Q61657 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hes3Q61657 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hes3Q61657 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hes3Q61657 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hes3Q61657 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hes3Q61657 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hes3Q61657 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hes3Q61657 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hes3Q61657 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hes3Q61657 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hes3Q61657 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hes3Q61657 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hes3Q61657 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hes3Q61657 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hes3Q61657 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hes3Q61657 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hes3Q61657 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hes3Q61657 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hes3Q61657 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hes3Q61657 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hes3Q61657 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hes3Q61657 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hes3Q61657 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hes3Q61657 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hes3Q61657 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hes3Q61657 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hes3Q61657 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hes3Q61657 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hes3Q61657 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hes3Q61657 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hes3Q61657 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hes3Q61657 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes3Q61657 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hes3Q61657 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hes3Q61657 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hes3Q61657 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hes3Q61657 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes3Q61657 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hes3Q61657 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hes3Q61657 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hes3Q61657 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hes3Q61657 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hes3Q61657 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hes3Q61657 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hes3Q61657 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hes3Q61657 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hes3Q61657 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hes3Q61657 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hes3Q61657 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hes3Q61657 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hes3Q61657 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hes3Q61657 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hes3Q61657 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hes3Q61657 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hes3Q61657 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hes3Q61657 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hes3Q61657 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hes3Q61657 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hes3Q61657 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hes3Q61657 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hes3Q61657 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hes3Q61657 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hes3Q61657 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hes3Q61657 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hes3Q61657 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hes3Q61657 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hes3Q61657 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hes3Q61657 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hes3Q61657 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hes3Q61657 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hes3Q61657 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hes3Q61657 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hes3Q61657 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms