Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CpQ61147 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CpQ61147 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CpQ61147 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CpQ61147 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CpQ61147 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CpQ61147 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CpQ61147 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CpQ61147 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CpQ61147 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CpQ61147 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CpQ61147 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CpQ61147 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CpQ61147 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CpQ61147 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CpQ61147 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CpQ61147 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CpQ61147 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CpQ61147 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CpQ61147 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CpQ61147 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CpQ61147 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CpQ61147 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CpQ61147 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CpQ61147 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CpQ61147 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CpQ61147 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CpQ61147 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CpQ61147 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CpQ61147 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CpQ61147 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CpQ61147 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CpQ61147 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CpQ61147 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CpQ61147 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CpQ61147 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CpQ61147 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CpQ61147 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CpQ61147 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CpQ61147 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CpQ61147 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CpQ61147 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CpQ61147 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CpQ61147 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CpQ61147 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CpQ61147 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CpQ61147 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CpQ61147 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CpQ61147 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CpQ61147 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CpQ61147 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CpQ61147 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CpQ61147 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CpQ61147 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CpQ61147 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CpQ61147 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CpQ61147 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CpQ61147 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CpQ61147 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CpQ61147 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CpQ61147 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CpQ61147 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CpQ61147 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CpQ61147 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CpQ61147 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CpQ61147 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CpQ61147 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CpQ61147 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CpQ61147 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CpQ61147 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CpQ61147 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CpQ61147 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CpQ61147 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CpQ61147 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CpQ61147 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CpQ61147 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CpQ61147 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CpQ61147 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CpQ61147 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CpQ61147 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CpQ61147 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CpQ61147 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CpQ61147 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CpQ61147 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CpQ61147 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CpQ61147 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CpQ61147 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CpQ61147 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CpQ61147 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CpQ61147 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CpQ61147 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CpQ61147 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CpQ61147 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CpQ61147 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CpQ61147 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CpQ61147 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CpQ61147 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpQ61147 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CpQ61147 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CpQ61147 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms