Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nr1h2Q60644 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nr1h2Q60644 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nr1h2Q60644 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nr1h2Q60644 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nr1h2Q60644 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nr1h2Q60644 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nr1h2Q60644 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nr1h2Q60644 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nr1h2Q60644 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nr1h2Q60644 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nr1h2Q60644 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nr1h2Q60644 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nr1h2Q60644 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nr1h2Q60644 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nr1h2Q60644 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nr1h2Q60644 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nr1h2Q60644 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nr1h2Q60644 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nr1h2Q60644 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nr1h2Q60644 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nr1h2Q60644 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr1h2Q60644 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nr1h2Q60644 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nr1h2Q60644 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nr1h2Q60644 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr1h2Q60644 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr1h2Q60644 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nr1h2Q60644 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nr1h2Q60644 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr1h2Q60644 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr1h2Q60644 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr1h2Q60644 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1h2Q60644 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1h2Q60644 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1h2Q60644 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1h2Q60644 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1h2Q60644 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1h2Q60644 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h2Q60644 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h2Q60644 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h2Q60644 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h2Q60644 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr1h2Q60644 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr1h2Q60644 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr1h2Q60644 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1h2Q60644 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nr1h2Q60644 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1h2Q60644 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr1h2Q60644 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr1h2Q60644 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1h2Q60644 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr1h2Q60644 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1h2Q60644 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1h2Q60644 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1h2Q60644 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr1h2Q60644 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr1h2Q60644 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr1h2Q60644 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr1h2Q60644 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr1h2Q60644 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nr1h2Q60644 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nr1h2Q60644 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nr1h2Q60644 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr1h2Q60644 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nr1h2Q60644 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr1h2Q60644 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr1h2Q60644 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nr1h2Q60644 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nr1h2Q60644 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nr1h2Q60644 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nr1h2Q60644 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nr1h2Q60644 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nr1h2Q60644 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr1h2Q60644 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr1h2Q60644 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr1h2Q60644 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nr1h2Q60644 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr1h2Q60644 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr1h2Q60644 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr1h2Q60644 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr1h2Q60644 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr1h2Q60644 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nr1h2Q60644 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1h2Q60644 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1h2Q60644 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr1h2Q60644 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1h2Q60644 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1h2Q60644 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1h2Q60644 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr1h2Q60644 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr1h2Q60644 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr1h2Q60644 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1h2Q60644 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1h2Q60644 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1h2Q60644 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1h2Q60644 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1h2Q60644 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1h2Q60644 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1h2Q60644 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms