Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CttnQ60598 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CttnQ60598 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CttnQ60598 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CttnQ60598 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CttnQ60598 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CttnQ60598 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CttnQ60598 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CttnQ60598 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CttnQ60598 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CttnQ60598 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CttnQ60598 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CttnQ60598 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CttnQ60598 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CttnQ60598 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CttnQ60598 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CttnQ60598 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CttnQ60598 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CttnQ60598 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CttnQ60598 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CttnQ60598 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CttnQ60598 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CttnQ60598 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CttnQ60598 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CttnQ60598 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CttnQ60598 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CttnQ60598 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CttnQ60598 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CttnQ60598 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CttnQ60598 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CttnQ60598 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CttnQ60598 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CttnQ60598 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CttnQ60598 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CttnQ60598 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CttnQ60598 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CttnQ60598 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CttnQ60598 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CttnQ60598 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CttnQ60598 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CttnQ60598 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CttnQ60598 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CttnQ60598 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CttnQ60598 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CttnQ60598 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CttnQ60598 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CttnQ60598 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CttnQ60598 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CttnQ60598 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CttnQ60598 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CttnQ60598 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CttnQ60598 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CttnQ60598 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CttnQ60598 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CttnQ60598 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CttnQ60598 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CttnQ60598 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CttnQ60598 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CttnQ60598 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CttnQ60598 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CttnQ60598 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CttnQ60598 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CttnQ60598 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CttnQ60598 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CttnQ60598 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CttnQ60598 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CttnQ60598 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CttnQ60598 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CttnQ60598 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CttnQ60598 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CttnQ60598 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CttnQ60598 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CttnQ60598 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CttnQ60598 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CttnQ60598 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CttnQ60598 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CttnQ60598 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CttnQ60598 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CttnQ60598 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CttnQ60598 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CttnQ60598 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CttnQ60598 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CttnQ60598 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CttnQ60598 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CttnQ60598 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CttnQ60598 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CttnQ60598 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CttnQ60598 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CttnQ60598 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CttnQ60598 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CttnQ60598 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CttnQ60598 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CttnQ60598 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CttnQ60598 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CttnQ60598 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CttnQ60598 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CttnQ60598 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CttnQ60598 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CttnQ60598 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CttnQ60598 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms