Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Setd5Q5XJV7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Setd5Q5XJV7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Setd5Q5XJV7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
Setd5Q5XJV7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Setd5Q5XJV7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Setd5Q5XJV7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Setd5Q5XJV7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Setd5Q5XJV7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
Setd5Q5XJV7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Setd5Q5XJV7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Setd5Q5XJV7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Setd5Q5XJV7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Setd5Q5XJV7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Setd5Q5XJV7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Setd5Q5XJV7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Setd5Q5XJV7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
Setd5Q5XJV7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Setd5Q5XJV7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Setd5Q5XJV7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
Setd5Q5XJV7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Setd5Q5XJV7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Setd5Q5XJV7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Setd5Q5XJV7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Setd5Q5XJV7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
Setd5Q5XJV7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
Setd5Q5XJV7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Setd5Q5XJV7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Setd5Q5XJV7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Setd5Q5XJV7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Setd5Q5XJV7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Setd5Q5XJV7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Setd5Q5XJV7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Setd5Q5XJV7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Setd5Q5XJV7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Setd5Q5XJV7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Setd5Q5XJV7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Setd5Q5XJV7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Setd5Q5XJV7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Setd5Q5XJV7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
Setd5Q5XJV7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Setd5Q5XJV7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Setd5Q5XJV7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Setd5Q5XJV7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Setd5Q5XJV7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Setd5Q5XJV7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Setd5Q5XJV7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Setd5Q5XJV7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Setd5Q5XJV7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Setd5Q5XJV7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
Setd5Q5XJV7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Setd5Q5XJV7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Setd5Q5XJV7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Setd5Q5XJV7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Setd5Q5XJV7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Setd5Q5XJV7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Setd5Q5XJV7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Setd5Q5XJV7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Setd5Q5XJV7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Setd5Q5XJV7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Setd5Q5XJV7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Setd5Q5XJV7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Setd5Q5XJV7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Setd5Q5XJV7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Setd5Q5XJV7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Setd5Q5XJV7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Setd5Q5XJV7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Setd5Q5XJV7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
Setd5Q5XJV7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Setd5Q5XJV7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Setd5Q5XJV7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
Setd5Q5XJV7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Setd5Q5XJV7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Setd5Q5XJV7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Setd5Q5XJV7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Setd5Q5XJV7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Setd5Q5XJV7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Setd5Q5XJV7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Setd5Q5XJV7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Setd5Q5XJV7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Setd5Q5XJV7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Setd5Q5XJV7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
Setd5Q5XJV7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Setd5Q5XJV7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Setd5Q5XJV7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Setd5Q5XJV7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Setd5Q5XJV7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Setd5Q5XJV7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Setd5Q5XJV7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Setd5Q5XJV7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Setd5Q5XJV7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Setd5Q5XJV7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Setd5Q5XJV7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Setd5Q5XJV7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Setd5Q5XJV7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Setd5Q5XJV7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Setd5Q5XJV7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Setd5Q5XJV7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Setd5Q5XJV7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Setd5Q5XJV7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms