Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc125Q5U465 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc125Q5U465 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc125Q5U465 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc125Q5U465 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc125Q5U465 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc125Q5U465 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc125Q5U465 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc125Q5U465 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc125Q5U465 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc125Q5U465 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc125Q5U465 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc125Q5U465 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc125Q5U465 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc125Q5U465 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc125Q5U465 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc125Q5U465 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc125Q5U465 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc125Q5U465 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc125Q5U465 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc125Q5U465 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc125Q5U465 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc125Q5U465 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc125Q5U465 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccdc125Q5U465 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc125Q5U465 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc125Q5U465 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc125Q5U465 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc125Q5U465 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc125Q5U465 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc125Q5U465 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc125Q5U465 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc125Q5U465 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc125Q5U465 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc125Q5U465 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc125Q5U465 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc125Q5U465 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc125Q5U465 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc125Q5U465 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc125Q5U465 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc125Q5U465 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc125Q5U465 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc125Q5U465 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc125Q5U465 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc125Q5U465 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc125Q5U465 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc125Q5U465 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc125Q5U465 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc125Q5U465 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc125Q5U465 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc125Q5U465 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccdc125Q5U465 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc125Q5U465 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc125Q5U465 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc125Q5U465 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc125Q5U465 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc125Q5U465 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc125Q5U465 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc125Q5U465 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc125Q5U465 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc125Q5U465 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc125Q5U465 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc125Q5U465 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc125Q5U465 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc125Q5U465 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc125Q5U465 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc125Q5U465 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc125Q5U465 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc125Q5U465 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc125Q5U465 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc125Q5U465 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc125Q5U465 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc125Q5U465 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc125Q5U465 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc125Q5U465 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc125Q5U465 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc125Q5U465 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc125Q5U465 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc125Q5U465 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc125Q5U465 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc125Q5U465 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc125Q5U465 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc125Q5U465 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc125Q5U465 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc125Q5U465 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc125Q5U465 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc125Q5U465 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc125Q5U465 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc125Q5U465 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc125Q5U465 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc125Q5U465 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc125Q5U465 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms