Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gm11487Q5RIS0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gm11487Q5RIS0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Gm11487Q5RIS0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gm11487Q5RIS0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gm11487Q5RIS0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gm11487Q5RIS0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Gm11487Q5RIS0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gm11487Q5RIS0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gm11487Q5RIS0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gm11487Q5RIS0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gm11487Q5RIS0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Gm11487Q5RIS0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gm11487Q5RIS0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gm11487Q5RIS0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Gm11487Q5RIS0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gm11487Q5RIS0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gm11487Q5RIS0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gm11487Q5RIS0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gm11487Q5RIS0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gm11487Q5RIS0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Gm11487Q5RIS0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm11487Q5RIS0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gm11487Q5RIS0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gm11487Q5RIS0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gm11487Q5RIS0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm11487Q5RIS0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gm11487Q5RIS0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gm11487Q5RIS0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Gm11487Q5RIS0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gm11487Q5RIS0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gm11487Q5RIS0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gm11487Q5RIS0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gm11487Q5RIS0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gm11487Q5RIS0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gm11487Q5RIS0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gm11487Q5RIS0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gm11487Q5RIS0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gm11487Q5RIS0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gm11487Q5RIS0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gm11487Q5RIS0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Gm11487Q5RIS0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gm11487Q5RIS0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gm11487Q5RIS0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gm11487Q5RIS0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gm11487Q5RIS0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Gm11487Q5RIS0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gm11487Q5RIS0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gm11487Q5RIS0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gm11487Q5RIS0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gm11487Q5RIS0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gm11487Q5RIS0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gm11487Q5RIS0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gm11487Q5RIS0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gm11487Q5RIS0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gm11487Q5RIS0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm11487Q5RIS0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm11487Q5RIS0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gm11487Q5RIS0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gm11487Q5RIS0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm11487Q5RIS0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm11487Q5RIS0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm11487Q5RIS0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm11487Q5RIS0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm11487Q5RIS0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gm11487Q5RIS0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gm11487Q5RIS0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gm11487Q5RIS0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gm11487Q5RIS0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Gm11487Q5RIS0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm11487Q5RIS0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gm11487Q5RIS0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm11487Q5RIS0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gm11487Q5RIS0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gm11487Q5RIS0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gm11487Q5RIS0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm11487Q5RIS0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm11487Q5RIS0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm11487Q5RIS0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm11487Q5RIS0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm11487Q5RIS0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm11487Q5RIS0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm11487Q5RIS0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm11487Q5RIS0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Gm11487Q5RIS0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm11487Q5RIS0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm11487Q5RIS0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm11487Q5RIS0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm11487Q5RIS0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm11487Q5RIS0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm11487Q5RIS0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm11487Q5RIS0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm11487Q5RIS0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm11487Q5RIS0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm11487Q5RIS0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gm11487Q5RIS0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm11487Q5RIS0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm11487Q5RIS0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm11487Q5RIS0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm11487Q5RIS0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms