Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCX5

Neurl4, Neuralized-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl4Q5NCX5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Neurl4Q5NCX5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Neurl4Q5NCX5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Neurl4Q5NCX5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Neurl4Q5NCX5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Neurl4Q5NCX5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
Neurl4Q5NCX5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
Neurl4Q5NCX5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Neurl4Q5NCX5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Neurl4Q5NCX5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Neurl4Q5NCX5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Neurl4Q5NCX5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Neurl4Q5NCX5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Neurl4Q5NCX5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Neurl4Q5NCX5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Neurl4Q5NCX5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Neurl4Q5NCX5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Neurl4Q5NCX5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Neurl4Q5NCX5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Neurl4Q5NCX5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Neurl4Q5NCX5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
Neurl4Q5NCX5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Neurl4Q5NCX5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Neurl4Q5NCX5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Neurl4Q5NCX5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Neurl4Q5NCX5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Neurl4Q5NCX5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Neurl4Q5NCX5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Neurl4Q5NCX5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Neurl4Q5NCX5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Neurl4Q5NCX5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Neurl4Q5NCX5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Neurl4Q5NCX5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Neurl4Q5NCX5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Neurl4Q5NCX5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Neurl4Q5NCX5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Neurl4Q5NCX5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Neurl4Q5NCX5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Neurl4Q5NCX5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Neurl4Q5NCX5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Neurl4Q5NCX5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Neurl4Q5NCX5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Neurl4Q5NCX5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Neurl4Q5NCX5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Neurl4Q5NCX5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Neurl4Q5NCX5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Neurl4Q5NCX5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Neurl4Q5NCX5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Neurl4Q5NCX5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Neurl4Q5NCX5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Neurl4Q5NCX5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Neurl4Q5NCX5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Neurl4Q5NCX5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Neurl4Q5NCX5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Neurl4Q5NCX5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Neurl4Q5NCX5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Neurl4Q5NCX5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Neurl4Q5NCX5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Neurl4Q5NCX5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Neurl4Q5NCX5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Neurl4Q5NCX5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Neurl4Q5NCX5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
Neurl4Q5NCX5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Neurl4Q5NCX5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Neurl4Q5NCX5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Neurl4Q5NCX5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Neurl4Q5NCX5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Neurl4Q5NCX5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Neurl4Q5NCX5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Neurl4Q5NCX5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Neurl4Q5NCX5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Neurl4Q5NCX5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Neurl4Q5NCX5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Neurl4Q5NCX5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Neurl4Q5NCX5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
Neurl4Q5NCX5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Neurl4Q5NCX5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Neurl4Q5NCX5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Neurl4Q5NCX5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Neurl4Q5NCX5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Neurl4Q5NCX5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Neurl4Q5NCX5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Neurl4Q5NCX5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Neurl4Q5NCX5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Neurl4Q5NCX5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
Neurl4Q5NCX5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Neurl4Q5NCX5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Neurl4Q5NCX5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Neurl4Q5NCX5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Neurl4Q5NCX5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Neurl4Q5NCX5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Neurl4Q5NCX5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Neurl4Q5NCX5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Neurl4Q5NCX5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Neurl4Q5NCX5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Neurl4Q5NCX5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Neurl4Q5NCX5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Neurl4Q5NCX5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Neurl4Q5NCX5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Neurl4Q5NCX5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms