Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
Trim41Q5NCC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
Trim41Q5NCC3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
Trim41Q5NCC3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
Trim41Q5NCC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
Trim41Q5NCC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC49.42■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC49.41■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
Trim41Q5NCC3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC49.37■■■■■ 5.49
Trim41Q5NCC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
Trim41Q5NCC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
Trim41Q5NCC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC49.31■■■■■ 5.48
Trim41Q5NCC3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
Trim41Q5NCC3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Trim41Q5NCC3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
Trim41Q5NCC3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
Trim41Q5NCC3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Trim41Q5NCC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
Trim41Q5NCC3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
Trim41Q5NCC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
Trim41Q5NCC3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
Trim41Q5NCC3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
Trim41Q5NCC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
Trim41Q5NCC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
Trim41Q5NCC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC48.72■■■■■ 5.39
Trim41Q5NCC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC48.68■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
Trim41Q5NCC3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
Trim41Q5NCC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
Trim41Q5NCC3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC48.52■■■■■ 5.36
Trim41Q5NCC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Trim41Q5NCC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
Trim41Q5NCC3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC48.39■■■■■ 5.34
Trim41Q5NCC3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Trim41Q5NCC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Trim41Q5NCC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Trim41Q5NCC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Trim41Q5NCC3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
Trim41Q5NCC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC48.26■■■■■ 5.32
Trim41Q5NCC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.31
Trim41Q5NCC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Trim41Q5NCC3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Trim41Q5NCC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC48.17■■■■■ 5.3
Trim41Q5NCC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
Trim41Q5NCC3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
Trim41Q5NCC3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Trim41Q5NCC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Trim41Q5NCC3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Trim41Q5NCC3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Trim41Q5NCC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Trim41Q5NCC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
Trim41Q5NCC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
Trim41Q5NCC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC47.85■■■■■ 5.25
Trim41Q5NCC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Trim41Q5NCC3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC47.77■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
Trim41Q5NCC3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Trim41Q5NCC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Trim41Q5NCC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
Trim41Q5NCC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Trim41Q5NCC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Trim41Q5NCC3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Trim41Q5NCC3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Trim41Q5NCC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
Trim41Q5NCC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Trim41Q5NCC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
Trim41Q5NCC3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
Trim41Q5NCC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Trim41Q5NCC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
Trim41Q5NCC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
Trim41Q5NCC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
Trim41Q5NCC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Trim41Q5NCC3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
Trim41Q5NCC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Trim41Q5NCC3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Trim41Q5NCC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Trim41Q5NCC3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
Trim41Q5NCC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Trim41Q5NCC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Trim41Q5NCC3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Trim41Q5NCC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Trim41Q5NCC3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Trim41Q5NCC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Trim41Q5NCC3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
Trim41Q5NCC3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Trim41Q5NCC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Trim41Q5NCC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC46.8■■■■■ 5.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms