Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
1700123L14RikQ3V2K7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
1700123L14RikQ3V2K7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
1700123L14RikQ3V2K7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
1700123L14RikQ3V2K7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
1700123L14RikQ3V2K7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
1700123L14RikQ3V2K7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
1700123L14RikQ3V2K7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
1700123L14RikQ3V2K7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
1700123L14RikQ3V2K7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
1700123L14RikQ3V2K7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
1700123L14RikQ3V2K7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
1700123L14RikQ3V2K7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
1700123L14RikQ3V2K7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
1700123L14RikQ3V2K7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
1700123L14RikQ3V2K7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
1700123L14RikQ3V2K7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
1700123L14RikQ3V2K7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
1700123L14RikQ3V2K7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
1700123L14RikQ3V2K7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
1700123L14RikQ3V2K7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
1700123L14RikQ3V2K7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
1700123L14RikQ3V2K7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
1700123L14RikQ3V2K7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
1700123L14RikQ3V2K7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
1700123L14RikQ3V2K7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
1700123L14RikQ3V2K7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
1700123L14RikQ3V2K7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
1700123L14RikQ3V2K7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
1700123L14RikQ3V2K7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
1700123L14RikQ3V2K7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
1700123L14RikQ3V2K7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
1700123L14RikQ3V2K7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
1700123L14RikQ3V2K7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
1700123L14RikQ3V2K7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
1700123L14RikQ3V2K7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
1700123L14RikQ3V2K7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
1700123L14RikQ3V2K7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
1700123L14RikQ3V2K7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
1700123L14RikQ3V2K7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
1700123L14RikQ3V2K7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
1700123L14RikQ3V2K7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
1700123L14RikQ3V2K7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
1700123L14RikQ3V2K7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
1700123L14RikQ3V2K7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
1700123L14RikQ3V2K7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
1700123L14RikQ3V2K7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
1700123L14RikQ3V2K7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
1700123L14RikQ3V2K7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
1700123L14RikQ3V2K7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
1700123L14RikQ3V2K7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
1700123L14RikQ3V2K7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
1700123L14RikQ3V2K7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
1700123L14RikQ3V2K7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
1700123L14RikQ3V2K7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
1700123L14RikQ3V2K7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
1700123L14RikQ3V2K7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
1700123L14RikQ3V2K7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
1700123L14RikQ3V2K7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
1700123L14RikQ3V2K7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
1700123L14RikQ3V2K7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
1700123L14RikQ3V2K7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
1700123L14RikQ3V2K7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
1700123L14RikQ3V2K7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
1700123L14RikQ3V2K7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
1700123L14RikQ3V2K7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
1700123L14RikQ3V2K7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
1700123L14RikQ3V2K7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
1700123L14RikQ3V2K7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
1700123L14RikQ3V2K7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
1700123L14RikQ3V2K7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
1700123L14RikQ3V2K7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
1700123L14RikQ3V2K7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
1700123L14RikQ3V2K7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
1700123L14RikQ3V2K7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
1700123L14RikQ3V2K7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
1700123L14RikQ3V2K7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
1700123L14RikQ3V2K7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
1700123L14RikQ3V2K7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
1700123L14RikQ3V2K7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
1700123L14RikQ3V2K7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
1700123L14RikQ3V2K7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
1700123L14RikQ3V2K7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms