Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY96

Cfap74, Cilia- and flagella-associated protein 74, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap74Q3UY96 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Cfap74Q3UY96 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Cfap74Q3UY96 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Cfap74Q3UY96 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
Cfap74Q3UY96 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Cfap74Q3UY96 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
Cfap74Q3UY96 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cfap74Q3UY96 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cfap74Q3UY96 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cfap74Q3UY96 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Cfap74Q3UY96 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Cfap74Q3UY96 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Cfap74Q3UY96 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
Cfap74Q3UY96 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Cfap74Q3UY96 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Cfap74Q3UY96 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Cfap74Q3UY96 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Cfap74Q3UY96 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Cfap74Q3UY96 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Cfap74Q3UY96 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Cfap74Q3UY96 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Cfap74Q3UY96 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Cfap74Q3UY96 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Cfap74Q3UY96 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41.88■■■■■ 4.3
Cfap74Q3UY96 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Cfap74Q3UY96 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Cfap74Q3UY96 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Cfap74Q3UY96 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Cfap74Q3UY96 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
Cfap74Q3UY96 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Cfap74Q3UY96 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Cfap74Q3UY96 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Cfap74Q3UY96 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Cfap74Q3UY96 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Cfap74Q3UY96 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Cfap74Q3UY96 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Cfap74Q3UY96 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Cfap74Q3UY96 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Cfap74Q3UY96 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Cfap74Q3UY96 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Cfap74Q3UY96 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Cfap74Q3UY96 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Cfap74Q3UY96 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Cfap74Q3UY96 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
Cfap74Q3UY96 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cfap74Q3UY96 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cfap74Q3UY96 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cfap74Q3UY96 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Cfap74Q3UY96 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Cfap74Q3UY96 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Cfap74Q3UY96 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Cfap74Q3UY96 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cfap74Q3UY96 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Cfap74Q3UY96 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Cfap74Q3UY96 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Cfap74Q3UY96 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Cfap74Q3UY96 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Cfap74Q3UY96 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Cfap74Q3UY96 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Cfap74Q3UY96 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Cfap74Q3UY96 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Cfap74Q3UY96 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Cfap74Q3UY96 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Cfap74Q3UY96 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Cfap74Q3UY96 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Cfap74Q3UY96 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Cfap74Q3UY96 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
Cfap74Q3UY96 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Cfap74Q3UY96 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Cfap74Q3UY96 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Cfap74Q3UY96 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Cfap74Q3UY96 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Cfap74Q3UY96 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Cfap74Q3UY96 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Cfap74Q3UY96 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Cfap74Q3UY96 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Cfap74Q3UY96 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cfap74Q3UY96 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Cfap74Q3UY96 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Cfap74Q3UY96 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cfap74Q3UY96 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Cfap74Q3UY96 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cfap74Q3UY96 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cfap74Q3UY96 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Cfap74Q3UY96 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Cfap74Q3UY96 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Cfap74Q3UY96 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Cfap74Q3UY96 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cfap74Q3UY96 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cfap74Q3UY96 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Cfap74Q3UY96 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Cfap74Q3UY96 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Cfap74Q3UY96 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Cfap74Q3UY96 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Cfap74Q3UY96 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Cfap74Q3UY96 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cfap74Q3UY96 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cfap74Q3UY96 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cfap74Q3UY96 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Cfap74Q3UY96 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms