Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130052B06RikQ3UW13 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130052B06RikQ3UW13 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130052B06RikQ3UW13 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130052B06RikQ3UW13 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130052B06RikQ3UW13 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130052B06RikQ3UW13 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130052B06RikQ3UW13 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130052B06RikQ3UW13 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D130052B06RikQ3UW13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
D130052B06RikQ3UW13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
D130052B06RikQ3UW13 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
D130052B06RikQ3UW13 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D130052B06RikQ3UW13 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D130052B06RikQ3UW13 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D130052B06RikQ3UW13 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D130052B06RikQ3UW13 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D130052B06RikQ3UW13 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D130052B06RikQ3UW13 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D130052B06RikQ3UW13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D130052B06RikQ3UW13 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D130052B06RikQ3UW13 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D130052B06RikQ3UW13 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
D130052B06RikQ3UW13 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D130052B06RikQ3UW13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130052B06RikQ3UW13 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D130052B06RikQ3UW13 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D130052B06RikQ3UW13 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D130052B06RikQ3UW13 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D130052B06RikQ3UW13 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D130052B06RikQ3UW13 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D130052B06RikQ3UW13 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D130052B06RikQ3UW13 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D130052B06RikQ3UW13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
D130052B06RikQ3UW13 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
D130052B06RikQ3UW13 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
D130052B06RikQ3UW13 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
D130052B06RikQ3UW13 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
D130052B06RikQ3UW13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
D130052B06RikQ3UW13 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
D130052B06RikQ3UW13 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
D130052B06RikQ3UW13 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
D130052B06RikQ3UW13 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
D130052B06RikQ3UW13 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
D130052B06RikQ3UW13 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D130052B06RikQ3UW13 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D130052B06RikQ3UW13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D130052B06RikQ3UW13 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D130052B06RikQ3UW13 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
D130052B06RikQ3UW13 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D130052B06RikQ3UW13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
D130052B06RikQ3UW13 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
D130052B06RikQ3UW13 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
D130052B06RikQ3UW13 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D130052B06RikQ3UW13 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
D130052B06RikQ3UW13 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D130052B06RikQ3UW13 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms