Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A530084C06RikQ3UTW2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A530084C06RikQ3UTW2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A530084C06RikQ3UTW2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A530084C06RikQ3UTW2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A530084C06RikQ3UTW2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A530084C06RikQ3UTW2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A530084C06RikQ3UTW2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A530084C06RikQ3UTW2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A530084C06RikQ3UTW2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A530084C06RikQ3UTW2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A530084C06RikQ3UTW2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A530084C06RikQ3UTW2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A530084C06RikQ3UTW2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A530084C06RikQ3UTW2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A530084C06RikQ3UTW2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A530084C06RikQ3UTW2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
A530084C06RikQ3UTW2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A530084C06RikQ3UTW2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A530084C06RikQ3UTW2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A530084C06RikQ3UTW2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A530084C06RikQ3UTW2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A530084C06RikQ3UTW2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A530084C06RikQ3UTW2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A530084C06RikQ3UTW2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A530084C06RikQ3UTW2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A530084C06RikQ3UTW2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A530084C06RikQ3UTW2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A530084C06RikQ3UTW2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A530084C06RikQ3UTW2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A530084C06RikQ3UTW2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A530084C06RikQ3UTW2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A530084C06RikQ3UTW2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A530084C06RikQ3UTW2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A530084C06RikQ3UTW2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A530084C06RikQ3UTW2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A530084C06RikQ3UTW2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530084C06RikQ3UTW2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530084C06RikQ3UTW2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms