Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B3gnt6Q3USF0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B3gnt6Q3USF0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B3gnt6Q3USF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B3gnt6Q3USF0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
B3gnt6Q3USF0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B3gnt6Q3USF0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B3gnt6Q3USF0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B3gnt6Q3USF0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B3gnt6Q3USF0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
B3gnt6Q3USF0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B3gnt6Q3USF0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B3gnt6Q3USF0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B3gnt6Q3USF0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B3gnt6Q3USF0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B3gnt6Q3USF0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B3gnt6Q3USF0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B3gnt6Q3USF0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B3gnt6Q3USF0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B3gnt6Q3USF0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B3gnt6Q3USF0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B3gnt6Q3USF0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B3gnt6Q3USF0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B3gnt6Q3USF0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B3gnt6Q3USF0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
B3gnt6Q3USF0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B3gnt6Q3USF0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B3gnt6Q3USF0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
B3gnt6Q3USF0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B3gnt6Q3USF0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3gnt6Q3USF0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3gnt6Q3USF0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B3gnt6Q3USF0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B3gnt6Q3USF0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B3gnt6Q3USF0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B3gnt6Q3USF0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3gnt6Q3USF0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B3gnt6Q3USF0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
B3gnt6Q3USF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B3gnt6Q3USF0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B3gnt6Q3USF0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B3gnt6Q3USF0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B3gnt6Q3USF0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B3gnt6Q3USF0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B3gnt6Q3USF0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B3gnt6Q3USF0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B3gnt6Q3USF0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B3gnt6Q3USF0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
B3gnt6Q3USF0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B3gnt6Q3USF0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B3gnt6Q3USF0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24■■□□□ 1.43
B3gnt6Q3USF0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B3gnt6Q3USF0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3gnt6Q3USF0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B3gnt6Q3USF0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B3gnt6Q3USF0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
B3gnt6Q3USF0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B3gnt6Q3USF0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
B3gnt6Q3USF0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
B3gnt6Q3USF0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
B3gnt6Q3USF0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B3gnt6Q3USF0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B3gnt6Q3USF0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
B3gnt6Q3USF0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
B3gnt6Q3USF0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B3gnt6Q3USF0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
B3gnt6Q3USF0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
B3gnt6Q3USF0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
B3gnt6Q3USF0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
B3gnt6Q3USF0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B3gnt6Q3USF0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B3gnt6Q3USF0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B3gnt6Q3USF0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B3gnt6Q3USF0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B3gnt6Q3USF0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
B3gnt6Q3USF0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
B3gnt6Q3USF0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B3gnt6Q3USF0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3gnt6Q3USF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B3gnt6Q3USF0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3gnt6Q3USF0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3gnt6Q3USF0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3gnt6Q3USF0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3gnt6Q3USF0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3gnt6Q3USF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3gnt6Q3USF0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
B3gnt6Q3USF0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3gnt6Q3USF0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3gnt6Q3USF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3gnt6Q3USF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms