Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ankrd27Q3UMR0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ankrd27Q3UMR0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ankrd27Q3UMR0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ankrd27Q3UMR0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ankrd27Q3UMR0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd27Q3UMR0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd27Q3UMR0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd27Q3UMR0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ankrd27Q3UMR0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ankrd27Q3UMR0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ankrd27Q3UMR0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ankrd27Q3UMR0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ankrd27Q3UMR0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ankrd27Q3UMR0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ankrd27Q3UMR0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ankrd27Q3UMR0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ankrd27Q3UMR0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ankrd27Q3UMR0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ankrd27Q3UMR0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ankrd27Q3UMR0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ankrd27Q3UMR0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ankrd27Q3UMR0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd27Q3UMR0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd27Q3UMR0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd27Q3UMR0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd27Q3UMR0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd27Q3UMR0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd27Q3UMR0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ankrd27Q3UMR0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd27Q3UMR0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd27Q3UMR0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd27Q3UMR0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd27Q3UMR0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd27Q3UMR0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ankrd27Q3UMR0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ankrd27Q3UMR0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd27Q3UMR0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd27Q3UMR0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd27Q3UMR0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd27Q3UMR0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd27Q3UMR0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd27Q3UMR0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd27Q3UMR0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd27Q3UMR0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd27Q3UMR0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd27Q3UMR0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ankrd27Q3UMR0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd27Q3UMR0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd27Q3UMR0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd27Q3UMR0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd27Q3UMR0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd27Q3UMR0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd27Q3UMR0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd27Q3UMR0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd27Q3UMR0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd27Q3UMR0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd27Q3UMR0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd27Q3UMR0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd27Q3UMR0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ankrd27Q3UMR0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ankrd27Q3UMR0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd27Q3UMR0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd27Q3UMR0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd27Q3UMR0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd27Q3UMR0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd27Q3UMR0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd27Q3UMR0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd27Q3UMR0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd27Q3UMR0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ankrd27Q3UMR0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd27Q3UMR0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms