Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc106Q3ULM0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc106Q3ULM0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc106Q3ULM0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc106Q3ULM0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc106Q3ULM0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc106Q3ULM0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc106Q3ULM0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc106Q3ULM0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc106Q3ULM0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc106Q3ULM0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc106Q3ULM0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc106Q3ULM0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc106Q3ULM0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc106Q3ULM0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc106Q3ULM0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc106Q3ULM0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc106Q3ULM0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc106Q3ULM0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc106Q3ULM0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc106Q3ULM0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc106Q3ULM0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc106Q3ULM0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc106Q3ULM0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc106Q3ULM0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc106Q3ULM0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc106Q3ULM0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc106Q3ULM0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc106Q3ULM0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc106Q3ULM0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc106Q3ULM0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc106Q3ULM0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc106Q3ULM0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc106Q3ULM0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc106Q3ULM0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc106Q3ULM0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc106Q3ULM0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc106Q3ULM0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc106Q3ULM0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc106Q3ULM0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc106Q3ULM0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc106Q3ULM0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc106Q3ULM0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc106Q3ULM0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc106Q3ULM0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc106Q3ULM0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc106Q3ULM0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc106Q3ULM0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc106Q3ULM0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc106Q3ULM0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc106Q3ULM0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc106Q3ULM0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc106Q3ULM0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc106Q3ULM0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc106Q3ULM0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc106Q3ULM0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc106Q3ULM0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc106Q3ULM0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc106Q3ULM0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc106Q3ULM0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc106Q3ULM0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc106Q3ULM0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc106Q3ULM0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc106Q3ULM0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc106Q3ULM0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc106Q3ULM0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc106Q3ULM0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc106Q3ULM0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc106Q3ULM0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc106Q3ULM0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc106Q3ULM0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc106Q3ULM0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc106Q3ULM0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc106Q3ULM0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc106Q3ULM0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc106Q3ULM0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc106Q3ULM0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc106Q3ULM0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc106Q3ULM0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc106Q3ULM0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc106Q3ULM0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc106Q3ULM0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms