Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc4Q3TR08 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc4Q3TR08 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc4Q3TR08 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc4Q3TR08 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc4Q3TR08 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc4Q3TR08 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc4Q3TR08 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc4Q3TR08 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc4Q3TR08 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc4Q3TR08 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc4Q3TR08 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc4Q3TR08 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc4Q3TR08 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc4Q3TR08 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc4Q3TR08 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc4Q3TR08 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc4Q3TR08 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc4Q3TR08 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc4Q3TR08 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc4Q3TR08 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc4Q3TR08 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc4Q3TR08 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc4Q3TR08 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc4Q3TR08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc4Q3TR08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc4Q3TR08 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc4Q3TR08 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc4Q3TR08 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc4Q3TR08 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc4Q3TR08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc4Q3TR08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc4Q3TR08 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc4Q3TR08 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc4Q3TR08 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc4Q3TR08 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc4Q3TR08 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc4Q3TR08 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc4Q3TR08 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc4Q3TR08 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc4Q3TR08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc4Q3TR08 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc4Q3TR08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc4Q3TR08 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc4Q3TR08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc4Q3TR08 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc4Q3TR08 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc4Q3TR08 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc4Q3TR08 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc4Q3TR08 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc4Q3TR08 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc4Q3TR08 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc4Q3TR08 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc4Q3TR08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc4Q3TR08 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc4Q3TR08 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc4Q3TR08 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc4Q3TR08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc4Q3TR08 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc4Q3TR08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc4Q3TR08 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc4Q3TR08 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc4Q3TR08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc4Q3TR08 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc4Q3TR08 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc4Q3TR08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc4Q3TR08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc4Q3TR08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc4Q3TR08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc4Q3TR08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc4Q3TR08 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc4Q3TR08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc4Q3TR08 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc4Q3TR08 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc4Q3TR08 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms