Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Myo3bQ1EG27 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Myo3bQ1EG27 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Myo3bQ1EG27 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Myo3bQ1EG27 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Myo3bQ1EG27 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Myo3bQ1EG27 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Myo3bQ1EG27 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Myo3bQ1EG27 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Myo3bQ1EG27 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Myo3bQ1EG27 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Myo3bQ1EG27 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Myo3bQ1EG27 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Myo3bQ1EG27 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Myo3bQ1EG27 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Myo3bQ1EG27 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Myo3bQ1EG27 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Myo3bQ1EG27 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Myo3bQ1EG27 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myo3bQ1EG27 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myo3bQ1EG27 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Myo3bQ1EG27 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myo3bQ1EG27 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Myo3bQ1EG27 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Myo3bQ1EG27 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Myo3bQ1EG27 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo3bQ1EG27 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo3bQ1EG27 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo3bQ1EG27 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo3bQ1EG27 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Myo3bQ1EG27 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Myo3bQ1EG27 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Myo3bQ1EG27 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Myo3bQ1EG27 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Myo3bQ1EG27 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Myo3bQ1EG27 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Myo3bQ1EG27 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Myo3bQ1EG27 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Myo3bQ1EG27 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Myo3bQ1EG27 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Myo3bQ1EG27 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Myo3bQ1EG27 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Myo3bQ1EG27 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Myo3bQ1EG27 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Myo3bQ1EG27 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Myo3bQ1EG27 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Myo3bQ1EG27 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Myo3bQ1EG27 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Myo3bQ1EG27 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Myo3bQ1EG27 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Myo3bQ1EG27 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Myo3bQ1EG27 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Myo3bQ1EG27 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Myo3bQ1EG27 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Myo3bQ1EG27 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Myo3bQ1EG27 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Myo3bQ1EG27 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Myo3bQ1EG27 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Myo3bQ1EG27 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Myo3bQ1EG27 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Myo3bQ1EG27 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Myo3bQ1EG27 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Myo3bQ1EG27 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Myo3bQ1EG27 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Myo3bQ1EG27 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Myo3bQ1EG27 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Myo3bQ1EG27 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Myo3bQ1EG27 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Myo3bQ1EG27 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Myo3bQ1EG27 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Myo3bQ1EG27 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Myo3bQ1EG27 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Myo3bQ1EG27 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Myo3bQ1EG27 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Myo3bQ1EG27 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Myo3bQ1EG27 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Myo3bQ1EG27 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Myo3bQ1EG27 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Myo3bQ1EG27 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Myo3bQ1EG27 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Myo3bQ1EG27 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo3bQ1EG27 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Myo3bQ1EG27 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Myo3bQ1EG27 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Myo3bQ1EG27 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Myo3bQ1EG27 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Myo3bQ1EG27 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Myo3bQ1EG27 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Myo3bQ1EG27 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo3bQ1EG27 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo3bQ1EG27 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Myo3bQ1EG27 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms