Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YGR021WYGR021W 873 nt10.95□□□□□ -0.66
RTR2Q12378 YJL225CYJL225C 5277 nt10.93□□□□□ -0.66
RTR2Q12378 GIS3YLR094C 1509 nt10.93□□□□□ -0.66
RTR2Q12378 WWM1YFL010C 636 nt10.92□□□□□ -0.66
RTR2Q12378 NPL3YDR432W 1245 nt10.91□□□□□ -0.66
RTR2Q12378 HOM6YJR139C 1080 nt10.91□□□□□ -0.66
RTR2Q12378 BOR1YNL275W 1731 nt10.9□□□□□ -0.66
RTR2Q12378 ALF1YNL148C 765 nt10.9□□□□□ -0.66
RTR2Q12378 YHL050CYHL050C 2094 nt10.89□□□□□ -0.67
RTR2Q12378 BOP3YNL042W 1191 nt10.87□□□□□ -0.67
RTR2Q12378 FUN26YAL022C 1554 nt10.85□□□□□ -0.67
RTR2Q12378 MNP1YGL068W 585 nt10.84□□□□□ -0.67
RTR2Q12378 PTK1YKL198C 1989 nt10.84□□□□□ -0.67
RTR2Q12378 YOL037CYOL037C 354 nt10.79□□□□□ -0.68
RTR2Q12378 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.77□□□□□ -0.69
RTR2Q12378 BDH2YAL061W 1254 nt10.77□□□□□ -0.69
RTR2Q12378 RKM5YLR137W 1104 nt10.75□□□□□ -0.69
RTR2Q12378 RRT12YCR045C 1476 nt10.74□□□□□ -0.69
RTR2Q12378 SIS1YNL007C 1059 nt10.73□□□□□ -0.69
RTR2Q12378 LSM3YLR438C-A 270 nt10.69□□□□□ -0.7
RTR2Q12378 TRM9YML014W 840 nt10.68□□□□□ -0.7
RTR2Q12378 YNL195CYNL195C 786 nt10.67□□□□□ -0.7
RTR2Q12378 GFD2YCL036W 1701 nt10.67□□□□□ -0.7
RTR2Q12378 RTS2YOR077W 699 nt10.66□□□□□ -0.7
RTR2Q12378 ART5YGR068C 1761 nt10.63□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 CCT6YDR188W 1641 nt10.61□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 YFL054CYFL054C 1941 nt10.6□□□□□ -0.71
RTR2Q12378 CUE1YMR264W 612 nt10.58□□□□□ -0.72
RTR2Q12378 SPT8YLR055C 1809 nt10.56□□□□□ -0.72
RTR2Q12378 MCH5YOR306C 1566 nt10.56□□□□□ -0.72
RTR2Q12378 NCP1YHR042W 2076 nt10.54□□□□□ -0.72
RTR2Q12378 YLR281CYLR281C 468 nt10.53□□□□□ -0.72
RTR2Q12378 PET9YBL030C 957 nt10.53□□□□□ -0.72
RTR2Q12378 YIL100WYIL100W 354 nt10.48□□□□□ -0.73
RTR2Q12378 ALG12YNR030W 1656 nt10.47□□□□□ -0.73
RTR2Q12378 PUS2YGL063W 1113 nt10.46□□□□□ -0.73
RTR2Q12378 HSP60YLR259C 1719 nt10.45□□□□□ -0.74
RTR2Q12378 WHI5YOR083W 888 nt10.45□□□□□ -0.74
RTR2Q12378 YCH1YGR203W 447 nt10.4□□□□□ -0.74
RTR2Q12378 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.37□□□□□ -0.75
RTR2Q12378 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.37□□□□□ -0.75
RTR2Q12378 SWE1YJL187C 2460 nt10.3□□□□□ -0.76
RTR2Q12378 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.3□□□□□ -0.76
RTR2Q12378 YLR236CYLR236C 324 nt10.29□□□□□ -0.76
RTR2Q12378 GLK1YCL040W 1503 nt10.28□□□□□ -0.76
RTR2Q12378 IMP2'YIL154C 1041 nt10.26□□□□□ -0.77
RTR2Q12378 MOT3YMR070W 1473 nt10.25□□□□□ -0.77
RTR2Q12378 TIR4YOR009W 1464 nt10.25□□□□□ -0.77
RTR2Q12378 YMR057CYMR057C 372 nt10.25□□□□□ -0.77
RTR2Q12378 DSK2YMR276W 1122 nt10.25□□□□□ -0.77
RTR2Q12378 YPR011CYPR011C 981 nt10.21□□□□□ -0.77
RTR2Q12378 LCB1YMR296C 1677 nt10.21□□□□□ -0.78
RTR2Q12378 FMP45YDL222C 930 nt10.18□□□□□ -0.78
RTR2Q12378 NAR1YNL240C 1476 nt10.17□□□□□ -0.78
RTR2Q12378 YJL152WYJL152W 360 nt10.14□□□□□ -0.79
RTR2Q12378 AAC1YMR056C 930 nt10.07□□□□□ -0.8
RTR2Q12378 FUR4YBR021W 1902 nt10.07□□□□□ -0.8
RTR2Q12378 IDH1YNL037C 1083 nt10.05□□□□□ -0.8
RTR2Q12378 PRP4YPR178W 1398 nt10.02□□□□□ -0.8
RTR2Q12378 ERV46YAL042W 1248 nt10.02□□□□□ -0.81
RTR2Q12378 LYS4YDR234W 2082 nt10.02□□□□□ -0.81
RTR2Q12378 BIO4YNR057C 714 nt10.01□□□□□ -0.81
RTR2Q12378 LPX1YOR084W 1164 nt10□□□□□ -0.81
RTR2Q12378 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.98□□□□□ -0.81
RTR2Q12378 YEL076CYEL076C 651 nt9.98□□□□□ -0.81
RTR2Q12378 YLR464WYLR464W 651 nt9.98□□□□□ -0.81
RTR2Q12378 DPS1YLL018C 1674 nt9.96□□□□□ -0.81
RTR2Q12378 YDR433WYDR433W 441 nt9.95□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 MRPL8YJL063C 717 nt9.95□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 GBP2YCL011C 1284 nt9.94□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.94□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 YKR040CYKR040C 504 nt9.92□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 SIM1YIL123W 1431 nt9.91□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 CMP2YML057W 1815 nt9.91□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 BIO5YNR056C 1686 nt9.9□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 CYT2YKL087C 675 nt9.9□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 RPM1RPM1 483 nt9.9□□□□□ -0.82
RTR2Q12378 PBP1YGR178C 2169 nt9.9□□□□□ -0.83
RTR2Q12378 BMT6YLR063W 1098 nt9.89□□□□□ -0.83
RTR2Q12378 SPP1YPL138C 1062 nt9.88□□□□□ -0.83
RTR2Q12378 MXR2YCL033C 507 nt9.84□□□□□ -0.83
RTR2Q12378 ADO1YJR105W 1023 nt9.82□□□□□ -0.84
RTR2Q12378 SNF1YDR477W 1902 nt9.82□□□□□ -0.84
RTR2Q12378 TCD2YKL027W 1344 nt9.8□□□□□ -0.84
RTR2Q12378 RTG1YOL067C 534 nt9.79□□□□□ -0.84
RTR2Q12378 HSL7YBR133C 2484 nt9.77□□□□□ -0.85
RTR2Q12378 YKR005CYKR005C 1578 nt9.77□□□□□ -0.85
RTR2Q12378 CCA1YER168C 1641 nt9.77□□□□□ -0.85
RTR2Q12378 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.74□□□□□ -0.85
RTR2Q12378 PCM1YEL058W 1674 nt9.74□□□□□ -0.85
RTR2Q12378 DED1YOR204W 1815 nt9.72□□□□□ -0.85
RTR2Q12378 FMP52YER004W 696 nt9.72□□□□□ -0.85
RTR2Q12378 RRD1YIL153W 1182 nt9.71□□□□□ -0.86
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