Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pglyrp4Q0VB07 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pglyrp4Q0VB07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pglyrp4Q0VB07 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pglyrp4Q0VB07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pglyrp4Q0VB07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pglyrp4Q0VB07 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pglyrp4Q0VB07 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pglyrp4Q0VB07 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pglyrp4Q0VB07 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pglyrp4Q0VB07 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pglyrp4Q0VB07 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pglyrp4Q0VB07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pglyrp4Q0VB07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pglyrp4Q0VB07 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pglyrp4Q0VB07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pglyrp4Q0VB07 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pglyrp4Q0VB07 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pglyrp4Q0VB07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pglyrp4Q0VB07 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pglyrp4Q0VB07 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pglyrp4Q0VB07 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pglyrp4Q0VB07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pglyrp4Q0VB07 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pglyrp4Q0VB07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pglyrp4Q0VB07 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pglyrp4Q0VB07 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pglyrp4Q0VB07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pglyrp4Q0VB07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pglyrp4Q0VB07 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pglyrp4Q0VB07 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pglyrp4Q0VB07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pglyrp4Q0VB07 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pglyrp4Q0VB07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pglyrp4Q0VB07 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pglyrp4Q0VB07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pglyrp4Q0VB07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pglyrp4Q0VB07 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pglyrp4Q0VB07 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pglyrp4Q0VB07 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pglyrp4Q0VB07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pglyrp4Q0VB07 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pglyrp4Q0VB07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pglyrp4Q0VB07 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pglyrp4Q0VB07 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pglyrp4Q0VB07 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pglyrp4Q0VB07 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pglyrp4Q0VB07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pglyrp4Q0VB07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pglyrp4Q0VB07 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pglyrp4Q0VB07 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pglyrp4Q0VB07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pglyrp4Q0VB07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms