Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NeblQ0II04 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NeblQ0II04 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NeblQ0II04 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NeblQ0II04 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NeblQ0II04 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NeblQ0II04 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NeblQ0II04 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NeblQ0II04 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NeblQ0II04 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NeblQ0II04 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NeblQ0II04 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NeblQ0II04 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NeblQ0II04 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeblQ0II04 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NeblQ0II04 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NeblQ0II04 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NeblQ0II04 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NeblQ0II04 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NeblQ0II04 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NeblQ0II04 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NeblQ0II04 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NeblQ0II04 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NeblQ0II04 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeblQ0II04 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeblQ0II04 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeblQ0II04 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NeblQ0II04 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NeblQ0II04 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeblQ0II04 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeblQ0II04 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NeblQ0II04 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NeblQ0II04 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NeblQ0II04 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NeblQ0II04 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NeblQ0II04 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NeblQ0II04 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NeblQ0II04 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NeblQ0II04 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NeblQ0II04 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NeblQ0II04 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NeblQ0II04 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NeblQ0II04 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NeblQ0II04 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NeblQ0II04 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NeblQ0II04 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NeblQ0II04 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NeblQ0II04 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NeblQ0II04 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NeblQ0II04 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NeblQ0II04 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NeblQ0II04 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NeblQ0II04 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NeblQ0II04 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NeblQ0II04 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NeblQ0II04 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NeblQ0II04 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NeblQ0II04 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeblQ0II04 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NeblQ0II04 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NeblQ0II04 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NeblQ0II04 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NeblQ0II04 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NeblQ0II04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeblQ0II04 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeblQ0II04 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeblQ0II04 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NeblQ0II04 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NeblQ0II04 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NeblQ0II04 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NeblQ0II04 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NeblQ0II04 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NeblQ0II04 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NeblQ0II04 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NeblQ0II04 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeblQ0II04 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeblQ0II04 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeblQ0II04 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NeblQ0II04 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NeblQ0II04 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NeblQ0II04 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NeblQ0II04 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NeblQ0II04 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NeblQ0II04 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NeblQ0II04 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NeblQ0II04 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NeblQ0II04 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NeblQ0II04 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NeblQ0II04 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NeblQ0II04 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeblQ0II04 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NeblQ0II04 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NeblQ0II04 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NeblQ0II04 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NeblQ0II04 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NeblQ0II04 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NeblQ0II04 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NeblQ0II04 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NeblQ0II04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms