Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gcnt1Q09324 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gcnt1Q09324 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gcnt1Q09324 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gcnt1Q09324 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Gcnt1Q09324 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gcnt1Q09324 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gcnt1Q09324 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gcnt1Q09324 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gcnt1Q09324 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gcnt1Q09324 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gcnt1Q09324 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gcnt1Q09324 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gcnt1Q09324 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Gcnt1Q09324 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Gcnt1Q09324 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Gcnt1Q09324 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gcnt1Q09324 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gcnt1Q09324 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gcnt1Q09324 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gcnt1Q09324 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gcnt1Q09324 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gcnt1Q09324 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Gcnt1Q09324 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gcnt1Q09324 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gcnt1Q09324 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gcnt1Q09324 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gcnt1Q09324 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gcnt1Q09324 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gcnt1Q09324 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gcnt1Q09324 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gcnt1Q09324 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gcnt1Q09324 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Gcnt1Q09324 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gcnt1Q09324 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Gcnt1Q09324 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Gcnt1Q09324 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Gcnt1Q09324 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gcnt1Q09324 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gcnt1Q09324 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gcnt1Q09324 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gcnt1Q09324 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gcnt1Q09324 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Gcnt1Q09324 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gcnt1Q09324 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gcnt1Q09324 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gcnt1Q09324 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Gcnt1Q09324 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gcnt1Q09324 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gcnt1Q09324 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gcnt1Q09324 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Gcnt1Q09324 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Gcnt1Q09324 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gcnt1Q09324 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gcnt1Q09324 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gcnt1Q09324 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gcnt1Q09324 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gcnt1Q09324 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gcnt1Q09324 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gcnt1Q09324 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gcnt1Q09324 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gcnt1Q09324 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gcnt1Q09324 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gcnt1Q09324 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gcnt1Q09324 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gcnt1Q09324 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gcnt1Q09324 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gcnt1Q09324 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gcnt1Q09324 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gcnt1Q09324 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Gcnt1Q09324 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gcnt1Q09324 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gcnt1Q09324 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gcnt1Q09324 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gcnt1Q09324 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gcnt1Q09324 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gcnt1Q09324 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gcnt1Q09324 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gcnt1Q09324 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Gcnt1Q09324 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Gcnt1Q09324 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gcnt1Q09324 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gcnt1Q09324 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gcnt1Q09324 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gcnt1Q09324 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gcnt1Q09324 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gcnt1Q09324 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gcnt1Q09324 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gcnt1Q09324 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gcnt1Q09324 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gcnt1Q09324 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gcnt1Q09324 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gcnt1Q09324 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gcnt1Q09324 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gcnt1Q09324 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gcnt1Q09324 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gcnt1Q09324 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gcnt1Q09324 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Gcnt1Q09324 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gcnt1Q09324 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms