Protein–RNA interactions for Protein: Q07660

BRE4, Protein BRE4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE4Q07660 RTF1YGL244W 1677 nt11.3□□□□□ -0.6
BRE4Q07660 YHL050CYHL050C 2094 nt11.28□□□□□ -0.6
BRE4Q07660 WWM1YFL010C 636 nt11.28□□□□□ -0.6
BRE4Q07660 YKL097CYKL097C 411 nt11.26□□□□□ -0.61
BRE4Q07660 SIS1YNL007C 1059 nt11.26□□□□□ -0.61
BRE4Q07660 CCT6YDR188W 1641 nt11.26□□□□□ -0.61
BRE4Q07660 TRM9YML014W 840 nt11.25□□□□□ -0.61
BRE4Q07660 FPS1YLL043W 2010 nt11.23□□□□□ -0.61
BRE4Q07660 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.23□□□□□ -0.61
BRE4Q07660 RTS2YOR077W 699 nt11.21□□□□□ -0.61
BRE4Q07660 GFD2YCL036W 1701 nt11.19□□□□□ -0.62
BRE4Q07660 YGR139WYGR139W 339 nt11.19□□□□□ -0.62
BRE4Q07660 LSM3YLR438C-A 270 nt11.19□□□□□ -0.62
BRE4Q07660 RRT12YCR045C 1476 nt11.18□□□□□ -0.62
BRE4Q07660 YGR021WYGR021W 873 nt11.17□□□□□ -0.62
BRE4Q07660 ART5YGR068C 1761 nt11.16□□□□□ -0.62
BRE4Q07660 BOP3YNL042W 1191 nt11.15□□□□□ -0.62
BRE4Q07660 PTK1YKL198C 1989 nt11.14□□□□□ -0.63
BRE4Q07660 HOM6YJR139C 1080 nt11.13□□□□□ -0.63
BRE4Q07660 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.11□□□□□ -0.63
BRE4Q07660 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.09□□□□□ -0.63
BRE4Q07660 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.09□□□□□ -0.63
BRE4Q07660 MNP1YGL068W 585 nt11.03□□□□□ -0.64
BRE4Q07660 CUE1YMR264W 612 nt11.03□□□□□ -0.64
BRE4Q07660 PET9YBL030C 957 nt11.01□□□□□ -0.65
BRE4Q07660 YNL195CYNL195C 786 nt11.01□□□□□ -0.65
BRE4Q07660 BOR1YNL275W 1731 nt11□□□□□ -0.65
BRE4Q07660 RKM5YLR137W 1104 nt10.96□□□□□ -0.65
BRE4Q07660 UME6YDR207C 2511 nt10.94□□□□□ -0.66
BRE4Q07660 TIR4YOR009W 1464 nt10.93□□□□□ -0.66
BRE4Q07660 YIL100WYIL100W 354 nt10.91□□□□□ -0.66
BRE4Q07660 NCP1YHR042W 2076 nt10.91□□□□□ -0.66
BRE4Q07660 YFL054CYFL054C 1941 nt10.9□□□□□ -0.66
BRE4Q07660 YCH1YGR203W 447 nt10.88□□□□□ -0.67
BRE4Q07660 SPT8YLR055C 1809 nt10.84□□□□□ -0.67
BRE4Q07660 YOR139CYOR139C 393 nt10.84□□□□□ -0.67
BRE4Q07660 YMR057CYMR057C 372 nt10.82□□□□□ -0.68
BRE4Q07660 YOL037CYOL037C 354 nt10.81□□□□□ -0.68
BRE4Q07660 NPL3YDR432W 1245 nt10.77□□□□□ -0.69
BRE4Q07660 YLR236CYLR236C 324 nt10.73□□□□□ -0.69
BRE4Q07660 MCH5YOR306C 1566 nt10.68□□□□□ -0.7
BRE4Q07660 HSP60YLR259C 1719 nt10.67□□□□□ -0.7
BRE4Q07660 LCB1YMR296C 1677 nt10.66□□□□□ -0.7
BRE4Q07660 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.63□□□□□ -0.71
BRE4Q07660 SWE1YJL187C 2460 nt10.62□□□□□ -0.71
BRE4Q07660 ALG12YNR030W 1656 nt10.59□□□□□ -0.71
BRE4Q07660 YLR281CYLR281C 468 nt10.58□□□□□ -0.72
BRE4Q07660 WHI5YOR083W 888 nt10.57□□□□□ -0.72
BRE4Q07660 YJL152WYJL152W 360 nt10.55□□□□□ -0.72
BRE4Q07660 NME1NME1 340 nt10.51□□□□□ -0.73
BRE4Q07660 GLK1YCL040W 1503 nt10.49□□□□□ -0.73
BRE4Q07660 RPM1RPM1 483 nt10.49□□□□□ -0.73
BRE4Q07660 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.49□□□□□ -0.73
BRE4Q07660 FRE6YLL051C 2139 nt10.48□□□□□ -0.73
BRE4Q07660 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.45□□□□□ -0.74
BRE4Q07660 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.45□□□□□ -0.74
BRE4Q07660 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.45□□□□□ -0.74
BRE4Q07660 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.45□□□□□ -0.74
BRE4Q07660 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.45□□□□□ -0.74
BRE4Q07660 PUS2YGL063W 1113 nt10.43□□□□□ -0.74
BRE4Q07660 LYS4YDR234W 2082 nt10.43□□□□□ -0.74
BRE4Q07660 RRD1YIL153W 1182 nt10.42□□□□□ -0.74
BRE4Q07660 YJL225CYJL225C 5277 nt10.39□□□□□ -0.75
BRE4Q07660 SIM1YIL123W 1431 nt10.37□□□□□ -0.75
BRE4Q07660 FUR4YBR021W 1902 nt10.35□□□□□ -0.75
BRE4Q07660 IMP2'YIL154C 1041 nt10.34□□□□□ -0.75
BRE4Q07660 IDH1YNL037C 1083 nt10.33□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 DED1YOR204W 1815 nt10.33□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 NAR1YNL240C 1476 nt10.32□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 DSK2YMR276W 1122 nt10.32□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 FMP52YER004W 696 nt10.3□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 YPR011CYPR011C 981 nt10.29□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 FMT1YBL013W 1206 nt10.28□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 BIO4YNR057C 714 nt10.28□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 GBP2YCL011C 1284 nt10.28□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 PCM1YEL058W 1674 nt10.28□□□□□ -0.76
BRE4Q07660 PRP4YPR178W 1398 nt10.26□□□□□ -0.77
BRE4Q07660 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.26□□□□□ -0.77
BRE4Q07660 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.26□□□□□ -0.77
BRE4Q07660 AAC1YMR056C 930 nt10.25□□□□□ -0.77
BRE4Q07660 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.21□□□□□ -0.77
BRE4Q07660 YEL076CYEL076C 651 nt10.21□□□□□ -0.77
BRE4Q07660 YLR464WYLR464W 651 nt10.21□□□□□ -0.77
BRE4Q07660 DPS1YLL018C 1674 nt10.2□□□□□ -0.78
BRE4Q07660 TCD2YKL027W 1344 nt10.18□□□□□ -0.78
BRE4Q07660 FMP45YDL222C 930 nt10.17□□□□□ -0.78
BRE4Q07660 YDR433WYDR433W 441 nt10.17□□□□□ -0.78
BRE4Q07660 ADH2YMR303C 1047 nt10.17□□□□□ -0.78
BRE4Q07660 CCA1YER168C 1641 nt10.16□□□□□ -0.78
BRE4Q07660 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.16□□□□□ -0.78
BRE4Q07660 BIO5YNR056C 1686 nt10.15□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 ERV46YAL042W 1248 nt10.14□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 LPX1YOR084W 1164 nt10.12□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 MXR2YCL033C 507 nt10.11□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 SOR2YDL246C 1074 nt10.1□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 SNF6YHL025W 999 nt10.1□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 SOR1YJR159W 1074 nt10.1□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 CWP1YKL096W 720 nt10.1□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 CRR1YLR213C 1269 nt10.1□□□□□ -0.79
BRE4Q07660 SNF1YDR477W 1902 nt10.09□□□□□ -0.79
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