Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sox13Q04891 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox13Q04891 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox13Q04891 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox13Q04891 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox13Q04891 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox13Q04891 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox13Q04891 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox13Q04891 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox13Q04891 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox13Q04891 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox13Q04891 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox13Q04891 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sox13Q04891 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox13Q04891 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sox13Q04891 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox13Q04891 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox13Q04891 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox13Q04891 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox13Q04891 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox13Q04891 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox13Q04891 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox13Q04891 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sox13Q04891 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox13Q04891 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox13Q04891 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sox13Q04891 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox13Q04891 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox13Q04891 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sox13Q04891 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sox13Q04891 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox13Q04891 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox13Q04891 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox13Q04891 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sox13Q04891 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox13Q04891 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox13Q04891 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox13Q04891 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sox13Q04891 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox13Q04891 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox13Q04891 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox13Q04891 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox13Q04891 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox13Q04891 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox13Q04891 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox13Q04891 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox13Q04891 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox13Q04891 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox13Q04891 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox13Q04891 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox13Q04891 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox13Q04891 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox13Q04891 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox13Q04891 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox13Q04891 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox13Q04891 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox13Q04891 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox13Q04891 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox13Q04891 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox13Q04891 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox13Q04891 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox13Q04891 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox13Q04891 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox13Q04891 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox13Q04891 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox13Q04891 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox13Q04891 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox13Q04891 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox13Q04891 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox13Q04891 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox13Q04891 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sox13Q04891 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox13Q04891 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox13Q04891 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox13Q04891 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox13Q04891 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox13Q04891 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox13Q04891 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox13Q04891 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox13Q04891 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox13Q04891 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox13Q04891 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox13Q04891 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sox13Q04891 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox13Q04891 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox13Q04891 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox13Q04891 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox13Q04891 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox13Q04891 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox13Q04891 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sox13Q04891 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms