Protein–RNA interactions for Protein: Q04779

RCO1, Transcriptional regulatory protein RCO1, yeastyeast

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RCO1Q04779 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.22□□□□□ -0.45
RCO1Q04779 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.22□□□□□ -0.45
RCO1Q04779 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.22□□□□□ -0.45
RCO1Q04779 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.22□□□□□ -0.45
RCO1Q04779 CAC2YML102W 1407 nt12.18□□□□□ -0.46
RCO1Q04779 WHI5YOR083W 888 nt12.17□□□□□ -0.46
RCO1Q04779 EMI2YDR516C 1503 nt12.16□□□□□ -0.46
RCO1Q04779 PUS2YGL063W 1113 nt12.11□□□□□ -0.47
RCO1Q04779 MOT3YMR070W 1473 nt12.09□□□□□ -0.47
RCO1Q04779 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.09□□□□□ -0.47
RCO1Q04779 ART5YGR068C 1761 nt12.09□□□□□ -0.47
RCO1Q04779 YDL221WYDL221W 552 nt12.08□□□□□ -0.48
RCO1Q04779 YMR090WYMR090W 684 nt12.06□□□□□ -0.48
RCO1Q04779 GFD2YCL036W 1701 nt12.05□□□□□ -0.48
RCO1Q04779 TIR4YOR009W 1464 nt12.04□□□□□ -0.48
RCO1Q04779 BDF1YLR399C 2061 nt12.03□□□□□ -0.48
RCO1Q04779 PET9YBL030C 957 nt12□□□□□ -0.49
RCO1Q04779 IRC15YPL017C 1500 nt11.98□□□□□ -0.49
RCO1Q04779 IMP2'YIL154C 1041 nt11.97□□□□□ -0.49
RCO1Q04779 YBR220CYBR220C 1683 nt11.97□□□□□ -0.49
RCO1Q04779 YJL152WYJL152W 360 nt11.96□□□□□ -0.49
RCO1Q04779 YCH1YGR203W 447 nt11.95□□□□□ -0.5
RCO1Q04779 DSK2YMR276W 1122 nt11.94□□□□□ -0.5
RCO1Q04779 SDH1YKL148C 1923 nt11.94□□□□□ -0.5
RCO1Q04779 RTS2YOR077W 699 nt11.93□□□□□ -0.5
RCO1Q04779 YMR057CYMR057C 372 nt11.92□□□□□ -0.5
RCO1Q04779 GIS3YLR094C 1509 nt11.91□□□□□ -0.5
RCO1Q04779 YLR236CYLR236C 324 nt11.9□□□□□ -0.5
RCO1Q04779 TAT1YBR069C 1860 nt11.87□□□□□ -0.51
RCO1Q04779 YPR011CYPR011C 981 nt11.86□□□□□ -0.51
RCO1Q04779 SCC4YER147C 1875 nt11.85□□□□□ -0.51
RCO1Q04779 FMP45YDL222C 930 nt11.81□□□□□ -0.52
RCO1Q04779 CUE1YMR264W 612 nt11.8□□□□□ -0.52
RCO1Q04779 IDH1YNL037C 1083 nt11.8□□□□□ -0.52
RCO1Q04779 FPS1YLL043W 2010 nt11.78□□□□□ -0.52
RCO1Q04779 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.75□□□□□ -0.53
RCO1Q04779 ERV46YAL042W 1248 nt11.72□□□□□ -0.53
RCO1Q04779 LPX1YOR084W 1164 nt11.67□□□□□ -0.54
RCO1Q04779 GBP2YCL011C 1284 nt11.66□□□□□ -0.54
RCO1Q04779 YIL100WYIL100W 354 nt11.65□□□□□ -0.54
RCO1Q04779 YDR433WYDR433W 441 nt11.61□□□□□ -0.55
RCO1Q04779 YSC84YHR016C 1407 nt11.58□□□□□ -0.56
RCO1Q04779 YKR040CYKR040C 504 nt11.57□□□□□ -0.56
RCO1Q04779 RRD1YIL153W 1182 nt11.55□□□□□ -0.56
RCO1Q04779 RRT12YCR045C 1476 nt11.55□□□□□ -0.56
RCO1Q04779 TCD2YKL027W 1344 nt11.54□□□□□ -0.56
RCO1Q04779 SEC11YIR022W 504 nt11.53□□□□□ -0.56
RCO1Q04779 YHL050CYHL050C 2094 nt11.53□□□□□ -0.56
RCO1Q04779 YNL195CYNL195C 786 nt11.52□□□□□ -0.57
RCO1Q04779 MXR2YCL033C 507 nt11.52□□□□□ -0.57
RCO1Q04779 DED1YOR204W 1815 nt11.51□□□□□ -0.57
RCO1Q04779 PCH2YBR186W 1695 nt11.49□□□□□ -0.57
RCO1Q04779 SPP1YPL138C 1062 nt11.44□□□□□ -0.58
RCO1Q04779 MRPL8YJL063C 717 nt11.43□□□□□ -0.58
RCO1Q04779 GUT2YIL155C 1950 nt11.43□□□□□ -0.58
RCO1Q04779 FMT1YBL013W 1206 nt11.42□□□□□ -0.58
RCO1Q04779 FMP52YER004W 696 nt11.39□□□□□ -0.59
RCO1Q04779 SOR2YDL246C 1074 nt11.37□□□□□ -0.59
RCO1Q04779 SOR1YJR159W 1074 nt11.37□□□□□ -0.59
RCO1Q04779 FRD1YEL047C 1413 nt11.36□□□□□ -0.59
RCO1Q04779 PAC11YDR488C 1602 nt11.35□□□□□ -0.59
RCO1Q04779 RTG1YOL067C 534 nt11.32□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 CWP1YKL096W 720 nt11.31□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 ADH2YMR303C 1047 nt11.3□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 YCL042WYCL042W 360 nt11.3□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 NVJ2YPR091C 2313 nt11.3□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 PCM1YEL058W 1674 nt11.3□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.29□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 YEL076CYEL076C 651 nt11.29□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 YLR464WYLR464W 651 nt11.29□□□□□ -0.6
RCO1Q04779 ADO1YJR105W 1023 nt11.27□□□□□ -0.61
RCO1Q04779 PIB2YGL023C 1908 nt11.27□□□□□ -0.61
RCO1Q04779 RTF1YGL244W 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
RCO1Q04779 SNF6YHL025W 999 nt11.21□□□□□ -0.61
RCO1Q04779 LCB1YMR296C 1677 nt11.2□□□□□ -0.62
RCO1Q04779 NCP1YHR042W 2076 nt11.2□□□□□ -0.62
RCO1Q04779 BOP3YNL042W 1191 nt11.2□□□□□ -0.62
RCO1Q04779 YLR235CYLR235C 399 nt11.17□□□□□ -0.62
RCO1Q04779 SIM1YIL123W 1431 nt11.17□□□□□ -0.62
RCO1Q04779 PTH1YHR189W 573 nt11.14□□□□□ -0.63
RCO1Q04779 BIO4YNR057C 714 nt11.12□□□□□ -0.63
RCO1Q04779 YKL030WYKL030W 606 nt11.11□□□□□ -0.63
RCO1Q04779 HUA1YGR268C 597 nt11.1□□□□□ -0.63
RCO1Q04779 YIH1YCR059C 777 nt11.09□□□□□ -0.63
RCO1Q04779 PTK1YKL198C 1989 nt11.07□□□□□ -0.64
RCO1Q04779 RNQ1YCL028W 1218 nt11.07□□□□□ -0.64
RCO1Q04779 DIC1YLR348C 897 nt11.06□□□□□ -0.64
RCO1Q04779 YLL053CYLL053C 459 nt11.02□□□□□ -0.65
RCO1Q04779 YJL225CYJL225C 5277 nt10.99□□□□□ -0.65
RCO1Q04779 TIM23YNR017W 669 nt10.99□□□□□ -0.65
RCO1Q04779 LYS4YDR234W 2082 nt10.97□□□□□ -0.65
RCO1Q04779 FTR1YER145C 1215 nt10.93□□□□□ -0.66
RCO1Q04779 ERF2YLR246W 1080 nt10.93□□□□□ -0.66
RCO1Q04779 YLR179CYLR179C 606 nt10.91□□□□□ -0.66
RCO1Q04779 CRR1YLR213C 1269 nt10.91□□□□□ -0.66
RCO1Q04779 ATF2YGR177C 1608 nt10.9□□□□□ -0.66
RCO1Q04779 GAL1YBR020W 1587 nt10.9□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 YFL054CYFL054C 1941 nt10.88□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 UBX6YJL048C 1191 nt10.88□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 AQY1YPR192W 918 nt10.88□□□□□ -0.67
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