Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Aplp1Q03157 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Aplp1Q03157 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Aplp1Q03157 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Aplp1Q03157 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Aplp1Q03157 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Aplp1Q03157 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Aplp1Q03157 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Aplp1Q03157 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Aplp1Q03157 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Aplp1Q03157 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Aplp1Q03157 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Aplp1Q03157 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Aplp1Q03157 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Aplp1Q03157 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Aplp1Q03157 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Aplp1Q03157 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Aplp1Q03157 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Aplp1Q03157 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Aplp1Q03157 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Aplp1Q03157 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Aplp1Q03157 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Aplp1Q03157 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Aplp1Q03157 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Aplp1Q03157 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Aplp1Q03157 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Aplp1Q03157 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Aplp1Q03157 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Aplp1Q03157 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Aplp1Q03157 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Aplp1Q03157 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Aplp1Q03157 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Aplp1Q03157 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Aplp1Q03157 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Aplp1Q03157 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Aplp1Q03157 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Aplp1Q03157 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Aplp1Q03157 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Aplp1Q03157 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Aplp1Q03157 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Aplp1Q03157 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Aplp1Q03157 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Aplp1Q03157 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Aplp1Q03157 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Aplp1Q03157 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Aplp1Q03157 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Aplp1Q03157 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Aplp1Q03157 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Aplp1Q03157 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Aplp1Q03157 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Aplp1Q03157 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Aplp1Q03157 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Aplp1Q03157 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Aplp1Q03157 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Aplp1Q03157 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Aplp1Q03157 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Aplp1Q03157 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Aplp1Q03157 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Aplp1Q03157 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Aplp1Q03157 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Aplp1Q03157 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Aplp1Q03157 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Aplp1Q03157 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Aplp1Q03157 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Aplp1Q03157 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Aplp1Q03157 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Aplp1Q03157 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Aplp1Q03157 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Aplp1Q03157 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Aplp1Q03157 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Aplp1Q03157 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Aplp1Q03157 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Aplp1Q03157 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Aplp1Q03157 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Aplp1Q03157 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Aplp1Q03157 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Aplp1Q03157 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Aplp1Q03157 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Aplp1Q03157 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Aplp1Q03157 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Aplp1Q03157 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Aplp1Q03157 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Aplp1Q03157 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Aplp1Q03157 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Aplp1Q03157 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Aplp1Q03157 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Aplp1Q03157 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Aplp1Q03157 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Aplp1Q03157 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Aplp1Q03157 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Aplp1Q03157 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Aplp1Q03157 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Aplp1Q03157 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Aplp1Q03157 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Aplp1Q03157 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Aplp1Q03157 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Aplp1Q03157 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Aplp1Q03157 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Aplp1Q03157 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Aplp1Q03157 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms