Protein–RNA interactions for Protein: Q03059

Chat, Choline O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChatQ03059 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ChatQ03059 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ChatQ03059 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ChatQ03059 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ChatQ03059 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ChatQ03059 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ChatQ03059 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ChatQ03059 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ChatQ03059 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ChatQ03059 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ChatQ03059 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ChatQ03059 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ChatQ03059 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ChatQ03059 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ChatQ03059 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ChatQ03059 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ChatQ03059 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ChatQ03059 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ChatQ03059 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ChatQ03059 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ChatQ03059 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ChatQ03059 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ChatQ03059 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ChatQ03059 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ChatQ03059 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ChatQ03059 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ChatQ03059 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ChatQ03059 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ChatQ03059 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ChatQ03059 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ChatQ03059 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ChatQ03059 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ChatQ03059 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ChatQ03059 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ChatQ03059 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ChatQ03059 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ChatQ03059 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChatQ03059 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChatQ03059 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ChatQ03059 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ChatQ03059 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ChatQ03059 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ChatQ03059 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ChatQ03059 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ChatQ03059 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ChatQ03059 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ChatQ03059 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ChatQ03059 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ChatQ03059 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ChatQ03059 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChatQ03059 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChatQ03059 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ChatQ03059 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ChatQ03059 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ChatQ03059 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChatQ03059 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ChatQ03059 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ChatQ03059 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ChatQ03059 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ChatQ03059 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ChatQ03059 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ChatQ03059 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ChatQ03059 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ChatQ03059 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ChatQ03059 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChatQ03059 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChatQ03059 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ChatQ03059 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChatQ03059 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChatQ03059 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ChatQ03059 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChatQ03059 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ChatQ03059 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChatQ03059 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ChatQ03059 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChatQ03059 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ChatQ03059 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ChatQ03059 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChatQ03059 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChatQ03059 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ChatQ03059 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChatQ03059 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChatQ03059 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChatQ03059 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChatQ03059 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChatQ03059 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ChatQ03059 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ChatQ03059 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChatQ03059 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChatQ03059 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChatQ03059 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChatQ03059 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChatQ03059 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChatQ03059 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChatQ03059 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChatQ03059 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChatQ03059 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChatQ03059 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChatQ03059 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChatQ03059 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms