Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Muc1Q02496 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Muc1Q02496 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Muc1Q02496 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Muc1Q02496 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Muc1Q02496 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Muc1Q02496 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Muc1Q02496 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Muc1Q02496 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Muc1Q02496 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Muc1Q02496 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Muc1Q02496 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Muc1Q02496 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Muc1Q02496 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Muc1Q02496 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Muc1Q02496 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Muc1Q02496 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Muc1Q02496 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Muc1Q02496 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Muc1Q02496 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Muc1Q02496 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Muc1Q02496 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Muc1Q02496 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Muc1Q02496 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Muc1Q02496 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Muc1Q02496 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Muc1Q02496 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Muc1Q02496 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31■■■□□ 2.55
Muc1Q02496 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Muc1Q02496 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Muc1Q02496 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Muc1Q02496 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Muc1Q02496 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Muc1Q02496 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Muc1Q02496 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Muc1Q02496 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Muc1Q02496 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Muc1Q02496 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Muc1Q02496 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Muc1Q02496 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Muc1Q02496 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Muc1Q02496 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Muc1Q02496 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Muc1Q02496 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Muc1Q02496 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Muc1Q02496 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Muc1Q02496 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Muc1Q02496 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Muc1Q02496 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Muc1Q02496 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Muc1Q02496 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Muc1Q02496 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Muc1Q02496 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Muc1Q02496 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Muc1Q02496 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Muc1Q02496 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Muc1Q02496 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Muc1Q02496 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Muc1Q02496 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Muc1Q02496 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Muc1Q02496 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Muc1Q02496 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Muc1Q02496 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Muc1Q02496 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Muc1Q02496 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Muc1Q02496 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Muc1Q02496 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Muc1Q02496 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Muc1Q02496 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Muc1Q02496 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Muc1Q02496 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Muc1Q02496 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Muc1Q02496 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Muc1Q02496 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Muc1Q02496 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Muc1Q02496 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Muc1Q02496 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Muc1Q02496 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Muc1Q02496 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Muc1Q02496 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Muc1Q02496 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Muc1Q02496 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Muc1Q02496 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Muc1Q02496 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Muc1Q02496 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Muc1Q02496 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Muc1Q02496 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Muc1Q02496 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Muc1Q02496 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Muc1Q02496 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Muc1Q02496 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Muc1Q02496 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Muc1Q02496 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Muc1Q02496 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Muc1Q02496 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Muc1Q02496 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Muc1Q02496 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Muc1Q02496 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Muc1Q02496 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Muc1Q02496 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms