Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 IRC15YPL017C 1500 nt11.48□□□□□ -0.57
CIK1Q01649 BDH2YAL061W 1254 nt11.47□□□□□ -0.57
CIK1Q01649 RTF1YGL244W 1677 nt11.44□□□□□ -0.58
CIK1Q01649 GIS3YLR094C 1509 nt11.42□□□□□ -0.58
CIK1Q01649 BOR1YNL275W 1731 nt11.41□□□□□ -0.58
CIK1Q01649 SHU1YHL006C 453 nt11.4□□□□□ -0.58
CIK1Q01649 YSC84YHR016C 1407 nt11.4□□□□□ -0.58
CIK1Q01649 SRB2YHR041C 633 nt11.38□□□□□ -0.59
CIK1Q01649 TRM9YML014W 840 nt11.37□□□□□ -0.59
CIK1Q01649 SIS1YNL007C 1059 nt11.37□□□□□ -0.59
CIK1Q01649 CCT6YDR188W 1641 nt11.33□□□□□ -0.6
CIK1Q01649 YHL050CYHL050C 2094 nt11.32□□□□□ -0.6
CIK1Q01649 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.3□□□□□ -0.6
CIK1Q01649 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.3□□□□□ -0.6
CIK1Q01649 BOP3YNL042W 1191 nt11.29□□□□□ -0.6
CIK1Q01649 PTK1YKL198C 1989 nt11.27□□□□□ -0.61
CIK1Q01649 GFD2YCL036W 1701 nt11.25□□□□□ -0.61
CIK1Q01649 LSM3YLR438C-A 270 nt11.21□□□□□ -0.61
CIK1Q01649 ART5YGR068C 1761 nt11.21□□□□□ -0.62
CIK1Q01649 RTS2YOR077W 699 nt11.16□□□□□ -0.62
CIK1Q01649 RRT12YCR045C 1476 nt11.16□□□□□ -0.62
CIK1Q01649 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.15□□□□□ -0.62
CIK1Q01649 PET9YBL030C 957 nt11.15□□□□□ -0.62
CIK1Q01649 YNL195CYNL195C 786 nt11.15□□□□□ -0.62
CIK1Q01649 WWM1YFL010C 636 nt11.14□□□□□ -0.63
CIK1Q01649 CUE1YMR264W 612 nt11.14□□□□□ -0.63
CIK1Q01649 MCH5YOR306C 1566 nt11.12□□□□□ -0.63
CIK1Q01649 YGR021WYGR021W 873 nt11.12□□□□□ -0.63
CIK1Q01649 YCH1YGR203W 447 nt11.08□□□□□ -0.64
CIK1Q01649 YOR139CYOR139C 393 nt11.07□□□□□ -0.64
CIK1Q01649 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.01□□□□□ -0.65
CIK1Q01649 YIL100WYIL100W 354 nt11.01□□□□□ -0.65
CIK1Q01649 HOM6YJR139C 1080 nt11.01□□□□□ -0.65
CIK1Q01649 NCP1YHR042W 2076 nt11□□□□□ -0.65
CIK1Q01649 YFL054CYFL054C 1941 nt11□□□□□ -0.65
CIK1Q01649 ALG12YNR030W 1656 nt10.98□□□□□ -0.65
CIK1Q01649 SPT8YLR055C 1809 nt10.98□□□□□ -0.65
CIK1Q01649 HSP60YLR259C 1719 nt10.92□□□□□ -0.66
CIK1Q01649 MNP1YGL068W 585 nt10.91□□□□□ -0.66
CIK1Q01649 TIR4YOR009W 1464 nt10.89□□□□□ -0.67
CIK1Q01649 NPL3YDR432W 1245 nt10.88□□□□□ -0.67
CIK1Q01649 YLR236CYLR236C 324 nt10.87□□□□□ -0.67
CIK1Q01649 RKM5YLR137W 1104 nt10.86□□□□□ -0.67
CIK1Q01649 YMR057CYMR057C 372 nt10.84□□□□□ -0.67
CIK1Q01649 YOL037CYOL037C 354 nt10.78□□□□□ -0.68
CIK1Q01649 GLK1YCL040W 1503 nt10.71□□□□□ -0.69
CIK1Q01649 SWE1YJL187C 2460 nt10.7□□□□□ -0.7
CIK1Q01649 LCB1YMR296C 1677 nt10.69□□□□□ -0.7
CIK1Q01649 NAR1YNL240C 1476 nt10.66□□□□□ -0.7
CIK1Q01649 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.64□□□□□ -0.71
CIK1Q01649 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.64□□□□□ -0.71
CIK1Q01649 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.64□□□□□ -0.71
CIK1Q01649 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.64□□□□□ -0.71
CIK1Q01649 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.64□□□□□ -0.71
CIK1Q01649 DSK2YMR276W 1122 nt10.6□□□□□ -0.71
CIK1Q01649 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.59□□□□□ -0.71
CIK1Q01649 RPM1RPM1 483 nt10.58□□□□□ -0.72
CIK1Q01649 YJL152WYJL152W 360 nt10.55□□□□□ -0.72
CIK1Q01649 YLR281CYLR281C 468 nt10.54□□□□□ -0.72
CIK1Q01649 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.52□□□□□ -0.73
CIK1Q01649 LYS4YDR234W 2082 nt10.51□□□□□ -0.73
CIK1Q01649 AAC1YMR056C 930 nt10.5□□□□□ -0.73
CIK1Q01649 PUS2YGL063W 1113 nt10.46□□□□□ -0.73
CIK1Q01649 WHI5YOR083W 888 nt10.46□□□□□ -0.73
CIK1Q01649 FUR4YBR021W 1902 nt10.46□□□□□ -0.74
CIK1Q01649 PRP4YPR178W 1398 nt10.43□□□□□ -0.74
CIK1Q01649 SIM1YIL123W 1431 nt10.42□□□□□ -0.74
CIK1Q01649 BIO4YNR057C 714 nt10.42□□□□□ -0.74
CIK1Q01649 CMP2YML057W 1815 nt10.4□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.39□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 YEL076CYEL076C 651 nt10.39□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 FMP52YER004W 696 nt10.39□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 YLR464WYLR464W 651 nt10.39□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 DPS1YLL018C 1674 nt10.38□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 CYT2YKL087C 675 nt10.36□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 PBP1YGR178C 2169 nt10.35□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 BIO5YNR056C 1686 nt10.34□□□□□ -0.75
CIK1Q01649 PCM1YEL058W 1674 nt10.33□□□□□ -0.76
CIK1Q01649 IMP2'YIL154C 1041 nt10.31□□□□□ -0.76
CIK1Q01649 HSL7YBR133C 2484 nt10.3□□□□□ -0.76
CIK1Q01649 RRD1YIL153W 1182 nt10.3□□□□□ -0.76
CIK1Q01649 BMT6YLR063W 1098 nt10.28□□□□□ -0.76
CIK1Q01649 YPR011CYPR011C 981 nt10.28□□□□□ -0.76
CIK1Q01649 IDH1YNL037C 1083 nt10.27□□□□□ -0.77
CIK1Q01649 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.24□□□□□ -0.77
CIK1Q01649 ERF2YLR246W 1080 nt10.23□□□□□ -0.77
CIK1Q01649 SNF1YDR477W 1902 nt10.22□□□□□ -0.77
CIK1Q01649 CRR1YLR213C 1269 nt10.2□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 GBP2YCL011C 1284 nt10.19□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 CCA1YER168C 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 SNF6YHL025W 999 nt10.18□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 FMP45YDL222C 930 nt10.17□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 TCD2YKL027W 1344 nt10.16□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 DED1YOR204W 1815 nt10.16□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 FRE6YLL051C 2139 nt10.16□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 RAX1YOR301W 1308 nt10.15□□□□□ -0.78
CIK1Q01649 YKR005CYKR005C 1578 nt10.14□□□□□ -0.79
CIK1Q01649 FMT1YBL013W 1206 nt10.11□□□□□ -0.79
CIK1Q01649 ADH2YMR303C 1047 nt10.11□□□□□ -0.79
CIK1Q01649 HEL2YDR266C 1920 nt10.1□□□□□ -0.79
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