Protein–RNA interactions for Protein: Q01590

SED5, Integral membrane protein SED5, yeastyeast

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED5Q01590 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.88□□□□□ -0.51
SED5Q01590 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.88□□□□□ -0.51
SED5Q01590 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.88□□□□□ -0.51
SED5Q01590 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.88□□□□□ -0.51
SED5Q01590 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.88□□□□□ -0.51
SED5Q01590 PCH2YBR186W 1695 nt11.85□□□□□ -0.51
SED5Q01590 YLR281CYLR281C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
SED5Q01590 RPP2AYOL039W 321 nt11.83□□□□□ -0.52
SED5Q01590 GUT2YIL155C 1950 nt11.82□□□□□ -0.52
SED5Q01590 CCT6YDR188W 1641 nt11.82□□□□□ -0.52
SED5Q01590 SCC4YER147C 1875 nt11.79□□□□□ -0.52
SED5Q01590 WHI5YOR083W 888 nt11.77□□□□□ -0.53
SED5Q01590 NVJ2YPR091C 2313 nt11.76□□□□□ -0.53
SED5Q01590 PUS2YGL063W 1113 nt11.76□□□□□ -0.53
SED5Q01590 SEC11YIR022W 504 nt11.76□□□□□ -0.53
SED5Q01590 IRC15YPL017C 1500 nt11.76□□□□□ -0.53
SED5Q01590 ALF1YNL148C 765 nt11.75□□□□□ -0.53
SED5Q01590 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.74□□□□□ -0.53
SED5Q01590 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.74□□□□□ -0.53
SED5Q01590 GIS3YLR094C 1509 nt11.69□□□□□ -0.54
SED5Q01590 PIB2YGL023C 1908 nt11.65□□□□□ -0.54
SED5Q01590 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.64□□□□□ -0.55
SED5Q01590 YSC84YHR016C 1407 nt11.61□□□□□ -0.55
SED5Q01590 SIS1YNL007C 1059 nt11.61□□□□□ -0.55
SED5Q01590 YHL050CYHL050C 2094 nt11.55□□□□□ -0.56
SED5Q01590 IMP2'YIL154C 1041 nt11.55□□□□□ -0.56
SED5Q01590 DSK2YMR276W 1122 nt11.54□□□□□ -0.56
SED5Q01590 GFD2YCL036W 1701 nt11.53□□□□□ -0.56
SED5Q01590 ART5YGR068C 1761 nt11.51□□□□□ -0.57
SED5Q01590 RTS2YOR077W 699 nt11.51□□□□□ -0.57
SED5Q01590 RTF1YGL244W 1677 nt11.5□□□□□ -0.57
SED5Q01590 YJL152WYJL152W 360 nt11.5□□□□□ -0.57
SED5Q01590 MOT3YMR070W 1473 nt11.47□□□□□ -0.57
SED5Q01590 YPR011CYPR011C 981 nt11.47□□□□□ -0.57
SED5Q01590 RRT12YCR045C 1476 nt11.46□□□□□ -0.57
SED5Q01590 FMP45YDL222C 930 nt11.46□□□□□ -0.57
SED5Q01590 YLR236CYLR236C 324 nt11.46□□□□□ -0.57
SED5Q01590 TIR4YOR009W 1464 nt11.4□□□□□ -0.58
SED5Q01590 YCH1YGR203W 447 nt11.39□□□□□ -0.59
SED5Q01590 PET9YBL030C 957 nt11.37□□□□□ -0.59
SED5Q01590 IDH1YNL037C 1083 nt11.37□□□□□ -0.59
SED5Q01590 BOP3YNL042W 1191 nt11.37□□□□□ -0.59
SED5Q01590 PTK1YKL198C 1989 nt11.37□□□□□ -0.59
SED5Q01590 CUE1YMR264W 612 nt11.35□□□□□ -0.59
SED5Q01590 YNL195CYNL195C 786 nt11.28□□□□□ -0.6
SED5Q01590 ERV46YAL042W 1248 nt11.27□□□□□ -0.61
SED5Q01590 YMR057CYMR057C 372 nt11.27□□□□□ -0.61
SED5Q01590 LPX1YOR084W 1164 nt11.26□□□□□ -0.61
SED5Q01590 YDR433WYDR433W 441 nt11.24□□□□□ -0.61
SED5Q01590 GBP2YCL011C 1284 nt11.24□□□□□ -0.61
SED5Q01590 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.22□□□□□ -0.61
SED5Q01590 YIL100WYIL100W 354 nt11.21□□□□□ -0.61
SED5Q01590 NCP1YHR042W 2076 nt11.18□□□□□ -0.62
SED5Q01590 YKR040CYKR040C 504 nt11.18□□□□□ -0.62
SED5Q01590 FPS1YLL043W 2010 nt11.15□□□□□ -0.62
SED5Q01590 MRPL8YJL063C 717 nt11.11□□□□□ -0.63
SED5Q01590 MXR2YCL033C 507 nt11.11□□□□□ -0.63
SED5Q01590 YFL054CYFL054C 1941 nt11.11□□□□□ -0.63
SED5Q01590 TCD2YKL027W 1344 nt11.1□□□□□ -0.63
SED5Q01590 SPP1YPL138C 1062 nt11.1□□□□□ -0.63
SED5Q01590 BOR1YNL275W 1731 nt11.09□□□□□ -0.63
SED5Q01590 SPT8YLR055C 1809 nt11.05□□□□□ -0.64
SED5Q01590 RRD1YIL153W 1182 nt11□□□□□ -0.65
SED5Q01590 DED1YOR204W 1815 nt10.99□□□□□ -0.65
SED5Q01590 ADO1YJR105W 1023 nt10.98□□□□□ -0.65
SED5Q01590 UME6YDR207C 2511 nt10.98□□□□□ -0.65
SED5Q01590 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.97□□□□□ -0.65
SED5Q01590 YEL076CYEL076C 651 nt10.97□□□□□ -0.65
SED5Q01590 YLR464WYLR464W 651 nt10.97□□□□□ -0.65
SED5Q01590 RTG1YOL067C 534 nt10.96□□□□□ -0.65
SED5Q01590 LCB1YMR296C 1677 nt10.95□□□□□ -0.66
SED5Q01590 FRD1YEL047C 1413 nt10.92□□□□□ -0.66
SED5Q01590 YCL042WYCL042W 360 nt10.9□□□□□ -0.66
SED5Q01590 Q0182Q0182 405 nt10.87□□□□□ -0.67
SED5Q01590 FMT1YBL013W 1206 nt10.87□□□□□ -0.67
SED5Q01590 SOR2YDL246C 1074 nt10.86□□□□□ -0.67
SED5Q01590 SOR1YJR159W 1074 nt10.86□□□□□ -0.67
SED5Q01590 FMP52YER004W 696 nt10.85□□□□□ -0.67
SED5Q01590 SWE1YJL187C 2460 nt10.82□□□□□ -0.68
SED5Q01590 HSP60YLR259C 1719 nt10.81□□□□□ -0.68
SED5Q01590 HUA1YGR268C 597 nt10.79□□□□□ -0.68
SED5Q01590 PTH1YHR189W 573 nt10.78□□□□□ -0.68
SED5Q01590 CWP1YKL096W 720 nt10.77□□□□□ -0.69
SED5Q01590 YLR235CYLR235C 399 nt10.77□□□□□ -0.69
SED5Q01590 YKL030WYKL030W 606 nt10.73□□□□□ -0.69
SED5Q01590 ADH2YMR303C 1047 nt10.73□□□□□ -0.69
SED5Q01590 LYS4YDR234W 2082 nt10.73□□□□□ -0.69
SED5Q01590 MCH5YOR306C 1566 nt10.72□□□□□ -0.69
SED5Q01590 ALG12YNR030W 1656 nt10.69□□□□□ -0.7
SED5Q01590 SIM1YIL123W 1431 nt10.68□□□□□ -0.7
SED5Q01590 PCM1YEL058W 1674 nt10.67□□□□□ -0.7
SED5Q01590 SNF6YHL025W 999 nt10.66□□□□□ -0.7
SED5Q01590 UBX6YJL048C 1191 nt10.66□□□□□ -0.7
SED5Q01590 GLK1YCL040W 1503 nt10.65□□□□□ -0.7
SED5Q01590 DIC1YLR348C 897 nt10.6□□□□□ -0.71
SED5Q01590 YDR094WYDR094W 336 nt10.59□□□□□ -0.71
SED5Q01590 TIM23YNR017W 669 nt10.59□□□□□ -0.71
SED5Q01590 RNQ1YCL028W 1218 nt10.57□□□□□ -0.72
SED5Q01590 YIH1YCR059C 777 nt10.56□□□□□ -0.72
SED5Q01590 FUR4YBR021W 1902 nt10.54□□□□□ -0.72
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